133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2638 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  96.45 
 
 
563 aa  1122    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  96.27 
 
 
509 aa  1012    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  98.97 
 
 
487 aa  988    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
563 aa  1157    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  47.74 
 
 
580 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  44.58 
 
 
573 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  44.76 
 
 
573 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  54.42 
 
 
293 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  34.52 
 
 
548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  34.31 
 
 
548 aa  226  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 
596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  31.08 
 
 
596 aa  213  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  31.26 
 
 
532 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  31.26 
 
 
532 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  30.08 
 
 
526 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  27.15 
 
 
587 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  27.15 
 
 
587 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  32.27 
 
 
538 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  32.27 
 
 
538 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  32.27 
 
 
538 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  32.27 
 
 
538 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 
548 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  27.14 
 
 
548 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  27.14 
 
 
548 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  27.67 
 
 
559 aa  156  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  22.7 
 
 
586 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  22.7 
 
 
586 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  22.7 
 
 
586 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  22.7 
 
 
586 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  22.7 
 
 
586 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  28.05 
 
 
594 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
562 aa  141  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  26.23 
 
 
562 aa  140  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  25.5 
 
 
562 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  27.76 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  29.92 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  29.92 
 
 
548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  28.36 
 
 
642 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  25.4 
 
 
562 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 
508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  27.04 
 
 
513 aa  127  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
414 aa  126  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  28.02 
 
 
561 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  31.72 
 
 
555 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  28.61 
 
 
508 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  27.04 
 
 
566 aa  124  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  28.07 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  31.48 
 
 
586 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  30.23 
 
 
578 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  30.28 
 
 
578 aa  120  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  30 
 
 
578 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  27.75 
 
 
511 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  32.19 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  32.19 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  26.44 
 
 
629 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  23.83 
 
 
554 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  24.44 
 
 
510 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  26.13 
 
 
570 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  26.13 
 
 
570 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  28.05 
 
 
522 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  26.01 
 
 
566 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5679  hypothetical protein  58.54 
 
 
194 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 
539 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  24.83 
 
 
537 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  24.83 
 
 
537 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  24.12 
 
 
538 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  27.5 
 
 
545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  28.28 
 
 
449 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  23.89 
 
 
538 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  23.89 
 
 
538 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  23.89 
 
 
538 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  23.89 
 
 
538 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  23.89 
 
 
538 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  24.05 
 
 
596 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  29.25 
 
 
359 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  26.42 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  23.04 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  37.5 
 
 
171 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  24.31 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  33.33 
 
 
604 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
604 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  33.33 
 
 
604 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1821  hypothetical protein  37.04 
 
 
260 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>