99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4700 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  100 
 
 
504 aa  1032    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  99.8 
 
 
504 aa  1030    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  99.8 
 
 
504 aa  1030    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  60.08 
 
 
522 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  40.96 
 
 
539 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  38.97 
 
 
545 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  38.97 
 
 
545 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  38.97 
 
 
545 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  38.97 
 
 
545 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  38.97 
 
 
545 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  36.55 
 
 
508 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  36.14 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  34.86 
 
 
511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  34.86 
 
 
511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  33.96 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  31.06 
 
 
596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  67.71 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  25.57 
 
 
570 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  25.57 
 
 
570 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  24.9 
 
 
510 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  25.24 
 
 
554 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  27.02 
 
 
538 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  27.02 
 
 
538 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  27.02 
 
 
538 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  27.02 
 
 
538 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  28.15 
 
 
562 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  25.22 
 
 
414 aa  97.8  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  25.1 
 
 
566 aa  97.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  25.07 
 
 
548 aa  97.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  25.07 
 
 
547 aa  97.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  25.41 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  29.11 
 
 
548 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  29.11 
 
 
548 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  29.11 
 
 
548 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  26.21 
 
 
532 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  26.89 
 
 
562 aa  91.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  26.21 
 
 
532 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  25.65 
 
 
540 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  25.65 
 
 
540 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  26.52 
 
 
562 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  26.61 
 
 
526 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  25 
 
 
559 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  25.39 
 
 
555 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  23.19 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  23.19 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  23.19 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  23.19 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  23.19 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  26.42 
 
 
563 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  25.61 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  25.61 
 
 
509 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  27.04 
 
 
558 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  24.94 
 
 
586 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  27.18 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  26 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  27.4 
 
 
578 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  27.4 
 
 
578 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  26.71 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  27.4 
 
 
578 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  25.91 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 
561 aa  80.1  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  24.79 
 
 
629 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  24.27 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  23.62 
 
 
580 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  25.12 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  25.3 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  25.12 
 
 
596 aa  70.5  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  24.88 
 
 
596 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  23.15 
 
 
642 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.75 
 
 
587 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.75 
 
 
587 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  30.62 
 
 
594 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  27.78 
 
 
449 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  29.69 
 
 
273 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  27.78 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  31.19 
 
 
632 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  27.57 
 
 
573 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0559  transposase  41.43 
 
 
100 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
573 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  21.51 
 
 
258 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2847  hypothetical protein  34.52 
 
 
263 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  23.32 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  23.32 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  23.32 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  23.32 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  23.32 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  23.32 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  43.14 
 
 
108 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  27.66 
 
 
130 aa  43.5  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2023  hypothetical protein  38.1 
 
 
174 aa  43.5  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0262122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>