97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2508 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  99.53 
 
 
632 aa  1299    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  99.37 
 
 
632 aa  1297    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
632 aa  1304    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  99.53 
 
 
632 aa  1299    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  99.53 
 
 
632 aa  1299    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  99.53 
 
 
632 aa  1299    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  99.37 
 
 
632 aa  1297    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  99.37 
 
 
632 aa  1297    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  32.96 
 
 
629 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  28.29 
 
 
642 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  26.37 
 
 
578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  26.37 
 
 
578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  26.17 
 
 
578 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  27.96 
 
 
538 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  27.96 
 
 
538 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  27.96 
 
 
538 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  27.96 
 
 
538 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  27.35 
 
 
561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 
596 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 
596 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 
596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  25.68 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  24.27 
 
 
540 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 
558 aa  112  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
563 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  24.59 
 
 
555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
509 aa  111  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  26.56 
 
 
487 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  23.55 
 
 
586 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 
579 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  26.01 
 
 
559 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  26.65 
 
 
532 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  26.65 
 
 
532 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
562 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  25.96 
 
 
526 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  26.67 
 
 
580 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  24.59 
 
 
573 aa  97.1  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  26.28 
 
 
562 aa  97.1  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  25 
 
 
573 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  23.51 
 
 
566 aa  94  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
562 aa  90.5  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  25.66 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  25.66 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  25.66 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  25.21 
 
 
562 aa  88.2  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  23.59 
 
 
547 aa  86.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  23.59 
 
 
548 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  26.19 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  25.15 
 
 
596 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  29.75 
 
 
171 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  25.97 
 
 
511 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  24.78 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  24.78 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  24.78 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  24.78 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  24.78 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  23.94 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  23.46 
 
 
508 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  28.09 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.93 
 
 
587 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.93 
 
 
587 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  20.68 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  20.68 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  20.68 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  20.68 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  20.68 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  23.17 
 
 
508 aa  71.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  24.55 
 
 
513 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 
522 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  21.99 
 
 
570 aa  64.7  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  21.33 
 
 
575 aa  64.7  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  21.99 
 
 
570 aa  64.7  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  23.29 
 
 
566 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  33.9 
 
 
539 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  24.32 
 
 
548 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  24.07 
 
 
548 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  31.19 
 
 
504 aa  53.9  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  30.51 
 
 
293 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  31.19 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  31.19 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  22.99 
 
 
359 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  24.05 
 
 
536 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  24.03 
 
 
273 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  21.99 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0559  transposase  31.73 
 
 
100 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0240  transposase IS4 family protein  24.09 
 
 
522 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>