31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25840  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1173    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04630  hypothetical protein  26.49 
 
 
534 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.27665  hitchhiker  0.000000619926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  24.24 
 
 
596 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  26.79 
 
 
562 aa  90.5  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  26.79 
 
 
562 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  21.18 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  21.18 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  24.2 
 
 
594 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  24.38 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  24.38 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  24.38 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  23.37 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  28.33 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  25.14 
 
 
559 aa  57  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  24.17 
 
 
539 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 
566 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  22.26 
 
 
547 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  22.67 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  22.67 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  22.67 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  22.67 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  22.67 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  22.26 
 
 
548 aa  49.7  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
563 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  21.14 
 
 
563 aa  47  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  21.65 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  21.15 
 
 
532 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  21.15 
 
 
532 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27660  hypothetical protein  33.87 
 
 
88 aa  45.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  22.11 
 
 
511 aa  44.3  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>