178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0784 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  68.33 
 
 
562 aa  794    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  68.45 
 
 
562 aa  793    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  68.27 
 
 
562 aa  792    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
562 aa  1124    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  54.12 
 
 
548 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  54.12 
 
 
548 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  54.12 
 
 
548 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  50.52 
 
 
594 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  49.82 
 
 
566 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0416  hypothetical protein  91.5 
 
 
196 aa  274  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.607955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  32.31 
 
 
538 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  32.31 
 
 
538 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  32.31 
 
 
538 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  32.31 
 
 
538 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  30.7 
 
 
532 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  30.7 
 
 
532 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  29.08 
 
 
596 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  28.91 
 
 
596 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  28.91 
 
 
596 aa  210  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  30.34 
 
 
526 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  30.8 
 
 
559 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 
561 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  30.33 
 
 
558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  29.98 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  29.8 
 
 
558 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  28.6 
 
 
578 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  28.26 
 
 
578 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  28.26 
 
 
578 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  26.22 
 
 
642 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  28.05 
 
 
566 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  24.96 
 
 
586 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  24.96 
 
 
586 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  24.96 
 
 
586 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  24.96 
 
 
586 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  24.96 
 
 
586 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  27.82 
 
 
555 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  28.79 
 
 
547 aa  153  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  28.79 
 
 
548 aa  153  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  27.65 
 
 
586 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
540 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  28.05 
 
 
540 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4134  hypothetical protein  51.35 
 
 
182 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  64.15 
 
 
108 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  26.61 
 
 
510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  25.21 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 
587 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 
587 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  25.95 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  25.4 
 
 
563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  29 
 
 
414 aa  120  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  27.48 
 
 
511 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 
487 aa  116  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  26.67 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 
508 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  26.91 
 
 
511 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  25.64 
 
 
508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  23.99 
 
 
548 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  26.14 
 
 
580 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  25.48 
 
 
573 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 
573 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  28.42 
 
 
449 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  22.27 
 
 
570 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  22.27 
 
 
570 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  21.93 
 
 
586 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  23.77 
 
 
513 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  25.41 
 
 
504 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  25.41 
 
 
504 aa  94.7  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  25.41 
 
 
504 aa  94.7  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  27.18 
 
 
596 aa  93.6  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  27.51 
 
 
275 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.9  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.9  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.9  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.5  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.5  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.5  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.5  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
632 aa  90.5  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  23.02 
 
 
570 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  23.02 
 
 
570 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  23.02 
 
 
570 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  23.02 
 
 
570 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  23.02 
 
 
570 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  27.15 
 
 
359 aa  87.4  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  25.16 
 
 
545 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  25.16 
 
 
545 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  25.16 
 
 
545 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  25.16 
 
 
545 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  25.16 
 
 
545 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  23.4 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  20.43 
 
 
575 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  23.56 
 
 
538 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0479  hypothetical protein  66.07 
 
 
85 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  23.56 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  23.56 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  23.56 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  23.56 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  23.56 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  23.9 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>