197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3741 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
548 aa  1098    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  85.54 
 
 
594 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1098    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1098    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  56.99 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  56.81 
 
 
562 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  55.91 
 
 
562 aa  599  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  54.12 
 
 
562 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  52.5 
 
 
566 aa  538  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4134  hypothetical protein  80.82 
 
 
182 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  32.06 
 
 
538 aa  223  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  32.06 
 
 
538 aa  223  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  32.06 
 
 
538 aa  223  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  32.06 
 
 
538 aa  223  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  29.25 
 
 
596 aa  193  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  29.25 
 
 
596 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  30.32 
 
 
526 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  29.05 
 
 
596 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  29.72 
 
 
532 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  29.72 
 
 
532 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  85.05 
 
 
108 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  31.73 
 
 
561 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  30.89 
 
 
559 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  28.99 
 
 
578 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  28.82 
 
 
578 aa  174  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  28.82 
 
 
578 aa  174  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 
563 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  28.88 
 
 
563 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  26.9 
 
 
555 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  27.66 
 
 
558 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  29.12 
 
 
579 aa  160  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  26.55 
 
 
586 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  27.13 
 
 
540 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  28.67 
 
 
558 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  29.41 
 
 
566 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
540 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  28.15 
 
 
547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  28.15 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  29.37 
 
 
509 aa  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.33 
 
 
487 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0416  hypothetical protein  52.94 
 
 
196 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.607955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  27.52 
 
 
554 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  27.18 
 
 
580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  21.82 
 
 
586 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  21.82 
 
 
586 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  21.82 
 
 
586 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  21.82 
 
 
586 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  21.82 
 
 
586 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.79 
 
 
587 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.79 
 
 
587 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  28.61 
 
 
414 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 
548 aa  124  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  26.87 
 
 
548 aa  123  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  27.34 
 
 
573 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  24.13 
 
 
596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  27.15 
 
 
573 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  25.27 
 
 
642 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0479  hypothetical protein  91.07 
 
 
85 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  25.72 
 
 
508 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  25.72 
 
 
508 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  29.31 
 
 
545 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  29.31 
 
 
545 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  29.31 
 
 
545 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  29.31 
 
 
545 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  29.31 
 
 
545 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  24.32 
 
 
570 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  24.32 
 
 
570 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  25.79 
 
 
511 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  25.53 
 
 
511 aa  100  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  25.09 
 
 
570 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  25.09 
 
 
570 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  25.09 
 
 
570 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  25 
 
 
570 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  25.09 
 
 
570 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  97.96 
 
 
81 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  26.64 
 
 
537 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  26.64 
 
 
537 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  29.11 
 
 
504 aa  94.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  26.97 
 
 
275 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 
504 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 
504 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  24.39 
 
 
604 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  24.39 
 
 
604 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  23.62 
 
 
629 aa  90.5  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 
522 aa  90.5  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  25.66 
 
 
632 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  25.66 
 
 
632 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  25.66 
 
 
632 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  25.66 
 
 
632 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  31.05 
 
 
359 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  25.24 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  25.24 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  25.24 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  25.24 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  25.24 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  25.24 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  23.82 
 
 
604 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  24.01 
 
 
513 aa  89.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  25.66 
 
 
632 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>