114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2231 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  100 
 
 
573 aa  1182    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  99.83 
 
 
573 aa  1181    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  48.44 
 
 
580 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  44.58 
 
 
563 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  44.58 
 
 
563 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  43.77 
 
 
509 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  43.88 
 
 
487 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  49.47 
 
 
293 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  33.12 
 
 
548 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  33.12 
 
 
548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  29.4 
 
 
596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  29.4 
 
 
596 aa  181  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
596 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  28.89 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  28.89 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  28.89 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  28.89 
 
 
538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  28.94 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  27.26 
 
 
594 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  26.01 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  27.57 
 
 
566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  28.23 
 
 
562 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  26.36 
 
 
532 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  26.36 
 
 
532 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  28.02 
 
 
562 aa  127  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  27.34 
 
 
548 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  27.34 
 
 
548 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  27.34 
 
 
548 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  25.2 
 
 
587 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  25.2 
 
 
587 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  27.03 
 
 
559 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  27.8 
 
 
629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  25.68 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  26.63 
 
 
579 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
562 aa  107  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  26.88 
 
 
558 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  23.55 
 
 
586 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  23.55 
 
 
586 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  23.55 
 
 
586 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  23.55 
 
 
586 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  23.55 
 
 
586 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  28.7 
 
 
555 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  26.63 
 
 
558 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  29 
 
 
540 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  29 
 
 
540 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  28.48 
 
 
586 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  27.29 
 
 
578 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  27.29 
 
 
578 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  27.06 
 
 
578 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 
632 aa  97.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  27.89 
 
 
359 aa  95.5  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  25.12 
 
 
566 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 
547 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 
548 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  22.82 
 
 
554 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 
596 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  24.33 
 
 
642 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  26.28 
 
 
414 aa  87.4  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  27.2 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  25.25 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  25 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5679  hypothetical protein  49.4 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  26.01 
 
 
508 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  26.2 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  22.38 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  22.38 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  26.62 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 
545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 
545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 
545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 
545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 
545 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  26.19 
 
 
275 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  35.37 
 
 
171 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  22.09 
 
 
522 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5699  hypothetical protein  36.46 
 
 
107 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.410912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  22.19 
 
 
570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  22.19 
 
 
570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  22.19 
 
 
570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  22.69 
 
 
570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  22.19 
 
 
570 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  21.43 
 
 
417 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  28.11 
 
 
504 aa  53.5  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  28.11 
 
 
504 aa  53.5  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  23.04 
 
 
604 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  20.37 
 
 
545 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  27.57 
 
 
504 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  20 
 
 
530 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  22.59 
 
 
586 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  22.59 
 
 
604 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  22.59 
 
 
604 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>