98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2645 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  100 
 
 
522 aa  1057    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  60.08 
 
 
504 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  60.08 
 
 
504 aa  586  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  60.08 
 
 
504 aa  586  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 
545 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 
545 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 
545 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 
545 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 
545 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  38.96 
 
 
539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  34.15 
 
 
508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  32.41 
 
 
511 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  33.94 
 
 
508 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  32.01 
 
 
511 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  31.52 
 
 
513 aa  210  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  85.98 
 
 
275 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  26.93 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  25.98 
 
 
596 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  24.45 
 
 
570 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  24.45 
 
 
570 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  21.89 
 
 
510 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  26.65 
 
 
414 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 
509 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  27.11 
 
 
547 aa  100  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  28.05 
 
 
563 aa  99.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  27.11 
 
 
548 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 
563 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  28.72 
 
 
559 aa  97.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.94 
 
 
487 aa  97.4  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  29.62 
 
 
538 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  29.62 
 
 
538 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  29.62 
 
 
538 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  29.62 
 
 
538 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  26.16 
 
 
548 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  26.16 
 
 
548 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  26.16 
 
 
548 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  25.19 
 
 
566 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  23.58 
 
 
532 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  23.58 
 
 
532 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  23.52 
 
 
526 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  27.81 
 
 
561 aa  84.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  29.22 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  24.38 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  25.7 
 
 
594 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  25.06 
 
 
562 aa  80.9  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
579 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  29.35 
 
 
558 aa  80.1  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  25.72 
 
 
642 aa  77.8  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  26.71 
 
 
548 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  25.08 
 
 
555 aa  73.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  27.51 
 
 
578 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  27.51 
 
 
578 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  25.94 
 
 
540 aa  70.5  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  25.94 
 
 
540 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  25.61 
 
 
580 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  28.37 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  24.76 
 
 
586 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  25.73 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  25.96 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  23.41 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  23.87 
 
 
566 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  23 
 
 
632 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  23 
 
 
632 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  23 
 
 
632 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  23.43 
 
 
596 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  23.41 
 
 
596 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  22.76 
 
 
632 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  20.55 
 
 
586 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  20.55 
 
 
586 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  20.55 
 
 
586 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  20.55 
 
 
586 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  20.55 
 
 
586 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  22.76 
 
 
632 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  22.76 
 
 
632 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  22.76 
 
 
632 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  22.76 
 
 
632 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  29.37 
 
 
449 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  22.91 
 
 
629 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  23.61 
 
 
587 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  23.61 
 
 
587 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2847  hypothetical protein  63.83 
 
 
263 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  22.09 
 
 
573 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  21.81 
 
 
573 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  26.39 
 
 
273 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  28.18 
 
 
562 aa  54.3  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  23.74 
 
 
258 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2142  transposase IS4 family protein  23.99 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  23.99 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  23.99 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  23.99 
 
 
520 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1456  transposase IS4 family protein  21.89 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  26.63 
 
 
293 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2023  hypothetical protein  35.44 
 
 
174 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0262122 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  30.11 
 
 
130 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0240  transposase IS4 family protein  21.55 
 
 
522 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2609  hypothetical protein  75.86 
 
 
83 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>