106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0436 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0436  transposase  100 
 
 
513 aa  1068    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  66.4 
 
 
508 aa  690    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  71.73 
 
 
511 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  72.12 
 
 
511 aa  775    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  66.8 
 
 
508 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  30.45 
 
 
545 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  30.45 
 
 
545 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  30.45 
 
 
545 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  30.45 
 
 
545 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  30.45 
 
 
545 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  31.59 
 
 
539 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  31.52 
 
 
522 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  33.96 
 
 
504 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  33.96 
 
 
504 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  33.96 
 
 
504 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  29.97 
 
 
554 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  25.59 
 
 
510 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  27.04 
 
 
563 aa  127  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.04 
 
 
487 aa  126  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 
563 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  27.47 
 
 
538 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  27.47 
 
 
538 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  27.47 
 
 
538 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  27.47 
 
 
538 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  26.8 
 
 
509 aa  124  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  27.2 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  27.2 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  26.57 
 
 
526 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  26.19 
 
 
562 aa  117  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  26.43 
 
 
562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2023  hypothetical protein  41.06 
 
 
174 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0262122 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  26.77 
 
 
547 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  26.51 
 
 
414 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  26.77 
 
 
548 aa  114  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  26.46 
 
 
562 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  25.26 
 
 
561 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 
540 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 
540 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  25.3 
 
 
555 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  24.28 
 
 
570 aa  97.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  24.28 
 
 
570 aa  97.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  23.77 
 
 
562 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  27.78 
 
 
580 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  23.13 
 
 
596 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  25.06 
 
 
586 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  23.46 
 
 
596 aa  94  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  24.93 
 
 
558 aa  93.2  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  23.25 
 
 
596 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  25 
 
 
579 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  24.16 
 
 
566 aa  91.3  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  22.28 
 
 
596 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  24.54 
 
 
558 aa  90.1  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  24.01 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  24.01 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  24.01 
 
 
548 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  27.64 
 
 
566 aa  87  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  24.39 
 
 
548 aa  86.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  26.74 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  26.46 
 
 
578 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  26.46 
 
 
578 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  25.19 
 
 
573 aa  84  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  25.19 
 
 
573 aa  83.6  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  25.57 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  22.34 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  24.05 
 
 
548 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  23.82 
 
 
594 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 
632 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  33.93 
 
 
273 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  21.48 
 
 
629 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  33.13 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  30.21 
 
 
449 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 
587 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 
587 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  32.97 
 
 
275 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  22.6 
 
 
586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  22.6 
 
 
586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  22.6 
 
 
586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  22.6 
 
 
586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  22.6 
 
 
586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  23.47 
 
 
359 aa  60.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  35.11 
 
 
171 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  32.65 
 
 
130 aa  53.5  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  20.48 
 
 
537 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  20.48 
 
 
537 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0559  transposase  32.73 
 
 
100 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  31.58 
 
 
577 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  31.58 
 
 
577 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  31.58 
 
 
577 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  20.38 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  20.38 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  20.38 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  20.38 
 
 
538 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>