91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5959 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  344  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  39.01 
 
 		 642 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  29.75 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 563 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 563 aa  72  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 487 aa  71.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  30.83 
 
 		 562 aa  71.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  29.33 
 
 		 562 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  28.67 
 
 		 562 aa  68.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  28.67 
 
 		 562 aa  68.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 629 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  32.43 
 
 		 548 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  32.43 
 
 		 548 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  29.8 
 
 		 594 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  32.43 
 
 		 548 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  35.51 
 
 		 580 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  28.15 
 
 		 275 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  31.91 
 
 		 526 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  30.97 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  31.91 
 
 		 532 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  31.91 
 
 		 532 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  25.77 
 
 		 566 aa  57.4  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  38.36 
 
 		 511 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  38.36 
 
 		 511 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  35.11 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  32.61 
 
 		 586 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  32.61 
 
 		 586 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  32.61 
 
 		 586 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  32.61 
 
 		 586 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  32.61 
 
 		 586 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 538 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 538 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 538 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 538 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 		 559 aa  54.7  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 		 508 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 		 508 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 414 aa  54.7  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 548 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  31.25 
 
 		 547 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  29.59 
 
 		 554 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  34.38 
 
 		 522 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 		 510 aa  50.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 579 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  29.49 
 
 		 596 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 558 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 558 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  35.82 
 
 		 570 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 555 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 540 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 587 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 587 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  35.82 
 
 		 570 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 586 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 540 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  33.33 
 
 		 504 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 504 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 504 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  30.39 
 
 		 548 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 		 596 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 		 596 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  31.4 
 
 		 596 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  28.85 
 
 		 561 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0559  transposase  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 539 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  22.56 
 
 		 575 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  29.41 
 
 		 548 aa  44.3  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  26.87 
 
 		 570 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  26.87 
 
 		 570 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  26.87 
 
 		 570 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  26.87 
 
 		 570 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  26.87 
 
 		 570 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  28.06 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  23.64 
 
 		 586 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  38.57 
 
 		 2547 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  38.71 
 
 		 578 aa  41.2  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  25.56 
 
 		 417 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  38.71 
 
 		 578 aa  41.2  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  38.71 
 
 		 578 aa  41.2  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>