166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2854 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0475  transposase  99.81 
 
 		 538 aa  1071    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  100 
 
 		 538 aa  1073    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  100 
 
 		 538 aa  1073    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  100 
 
 		 538 aa  1073    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  100 
 
 		 538 aa  1073    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  100 
 
 		 538 aa  1073    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  84.2 
 
 		 537 aa  882    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  84.2 
 
 		 537 aa  882    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3083  hypothetical protein  84.19 
 
 		 417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3021  hypothetical protein  56.03 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  28.6 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  28.6 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  24.86 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  24.86 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  24.86 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  24.62 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  24.62 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  24.57 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5319  hypothetical protein  59.6 
 
 		 126 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  26.2 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  26.2 
 
 		 534 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  26.2 
 
 		 534 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  31.39 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  24.05 
 
 		 552 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  24.05 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  24.05 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  24.05 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  24.05 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  24.91 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  24.91 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  23.96 
 
 		 552 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  23.96 
 
 		 552 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  23.96 
 
 		 552 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  23.96 
 
 		 552 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  23.96 
 
 		 552 aa  97.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  23.77 
 
 		 552 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  23.96 
 
 		 552 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  22.75 
 
 		 604 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  22.14 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  22.14 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  22.66 
 
 		 604 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  22.66 
 
 		 604 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  22.66 
 
 		 604 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  22.22 
 
 		 604 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  25.55 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  23.77 
 
 		 552 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  23.4 
 
 		 552 aa  94.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  24.76 
 
 		 509 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  24.55 
 
 		 563 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  23.33 
 
 		 552 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  25.18 
 
 		 563 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  24.29 
 
 		 487 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  23.48 
 
 		 552 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  22.15 
 
 		 603 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  23.14 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  22.27 
 
 		 545 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  23.48 
 
 		 552 aa  90.9  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  25.71 
 
 		 548 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  25.71 
 
 		 548 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  25.71 
 
 		 548 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  21.5 
 
 		 604 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  23.12 
 
 		 536 aa  87  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  23.65 
 
 		 562 aa  87  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  21.96 
 
 		 604 aa  87  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  21.96 
 
 		 604 aa  87  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  30.27 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  23.96 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  25.89 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  22.72 
 
 		 536 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  22.72 
 
 		 536 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  25.6 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  20.77 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0555  transposase, IS4  20.77 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  20.77 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  20.77 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  20.77 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3134  transposase, IS4  20.77 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 560 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  25.72 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  23.51 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  23.31 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  23.26 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  27.4 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  22.25 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  25.3 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  25.3 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>