158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3161 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
547 aa  1106    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  97.57 
 
 
414 aa  824    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
548 aa  1107    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  58.27 
 
 
559 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  89.61 
 
 
258 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  36.23 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  36.23 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  36.23 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  36.23 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  34.2 
 
 
532 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  34.2 
 
 
532 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  34.39 
 
 
526 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  98.46 
 
 
130 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3431  hypothetical protein  85.09 
 
 
147 aa  195  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  29.42 
 
 
561 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  29.31 
 
 
578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  29.13 
 
 
578 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  29.13 
 
 
578 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
540 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  27.97 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 
596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 
596 aa  174  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  28.1 
 
 
555 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  28.6 
 
 
558 aa  173  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  29.42 
 
 
558 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  29.64 
 
 
579 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
586 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  29.09 
 
 
562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  28.92 
 
 
562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  29.25 
 
 
562 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  28.15 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  28.15 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  28.15 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  28.79 
 
 
562 aa  153  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
566 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  27.19 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  30.18 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  29.92 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  30.35 
 
 
509 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  30.35 
 
 
563 aa  127  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  29.69 
 
 
359 aa  127  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 
594 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  30.39 
 
 
508 aa  120  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 
511 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  30.39 
 
 
508 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  29.77 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  26.77 
 
 
513 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  25.98 
 
 
566 aa  113  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  20.22 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  27.86 
 
 
642 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
545 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
545 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
545 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
545 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
545 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  24.28 
 
 
629 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  29.15 
 
 
449 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  20.51 
 
 
587 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  20.51 
 
 
587 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  27.11 
 
 
522 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  26.07 
 
 
539 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  24.21 
 
 
548 aa  97.8  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  25.07 
 
 
504 aa  97.4  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  23.73 
 
 
548 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
504 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  24.78 
 
 
504 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  29.96 
 
 
275 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 
573 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 
573 aa  89.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  22.47 
 
 
586 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  22.47 
 
 
586 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  22.47 
 
 
586 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  22.47 
 
 
586 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  22.47 
 
 
586 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  23.59 
 
 
632 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  23.59 
 
 
632 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  23.59 
 
 
632 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  23.59 
 
 
632 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  23.59 
 
 
632 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  23.42 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  23.42 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  23.42 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  26.65 
 
 
580 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  21.38 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  21.38 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
596 aa  74.3  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  21.52 
 
 
575 aa  63.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  35.35 
 
 
534 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1507  hypothetical protein  28.66 
 
 
209 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.537606  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  29.71 
 
 
293 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  23.67 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  23.67 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  23.67 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  23.67 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1833  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  24.05 
 
 
520 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  24.05 
 
 
520 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  23.67 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  24.05 
 
 
520 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>