154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3060 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  95.29 
 
 
558 aa  950    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  98.24 
 
 
558 aa  1025    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  100 
 
 
579 aa  1183    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  60.74 
 
 
578 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  60.74 
 
 
578 aa  609  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  60.54 
 
 
578 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  58.71 
 
 
586 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  58.51 
 
 
555 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  59.12 
 
 
540 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  59.12 
 
 
540 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  41.62 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  40.62 
 
 
566 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  47.34 
 
 
449 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  38 
 
 
538 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  38 
 
 
538 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  38 
 
 
538 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  38 
 
 
538 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  36.27 
 
 
526 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  36.55 
 
 
532 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  36.55 
 
 
532 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  46.08 
 
 
359 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  32.57 
 
 
596 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  32.38 
 
 
596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  32.38 
 
 
596 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  30.47 
 
 
562 aa  200  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  30 
 
 
547 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  30 
 
 
548 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  30.33 
 
 
562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  30.13 
 
 
562 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  29.46 
 
 
548 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  29.46 
 
 
548 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  29.46 
 
 
548 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  31.31 
 
 
559 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  29.94 
 
 
562 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  27.86 
 
 
594 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  27.06 
 
 
566 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  32.2 
 
 
414 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  28.86 
 
 
642 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  28.6 
 
 
563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 
563 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 
596 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  29.53 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  24.8 
 
 
510 aa  140  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  29.38 
 
 
487 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  24.44 
 
 
586 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  24.44 
 
 
586 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  24.44 
 
 
586 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  24.44 
 
 
586 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  24.44 
 
 
586 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  24.15 
 
 
554 aa  134  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  23.31 
 
 
570 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  23.31 
 
 
570 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  22.68 
 
 
587 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  22.68 
 
 
587 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
632 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  26.63 
 
 
511 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
511 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  28.33 
 
 
508 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  30.08 
 
 
580 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  27.21 
 
 
573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  25 
 
 
513 aa  114  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  28.05 
 
 
508 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 
573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  27.91 
 
 
548 aa  109  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  27.66 
 
 
548 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  29.32 
 
 
539 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 
629 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  23.93 
 
 
570 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  23.93 
 
 
570 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  23.93 
 
 
570 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  23.93 
 
 
570 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  23.93 
 
 
570 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  24.65 
 
 
275 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  27.98 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  27.98 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  27.98 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  27.98 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  27.98 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  29.35 
 
 
522 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  26.86 
 
 
504 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  26.86 
 
 
504 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  26.86 
 
 
504 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  21.79 
 
 
575 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  28.12 
 
 
258 aa  84  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  27.65 
 
 
537 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  27.65 
 
 
537 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4134  hypothetical protein  33.99 
 
 
182 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  26.35 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  26.35 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  26.35 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  26.35 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  26.35 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  23.99 
 
 
586 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>