123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0325 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
554 aa  1144    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  87.06 
 
 
273 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  78.99 
 
 
275 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  28.67 
 
 
510 aa  189  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  29.04 
 
 
538 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  29.04 
 
 
538 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  31.01 
 
 
511 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  27.68 
 
 
532 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  27.68 
 
 
532 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  29.04 
 
 
538 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  29.04 
 
 
538 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  27.85 
 
 
526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  30.75 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  29.97 
 
 
513 aa  176  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  30.97 
 
 
508 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  30.68 
 
 
508 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  29.06 
 
 
596 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  27.29 
 
 
539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  27.75 
 
 
545 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  27.75 
 
 
545 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  27.75 
 
 
545 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  27.75 
 
 
545 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  27.75 
 
 
545 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  25.88 
 
 
562 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  25.88 
 
 
562 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  29.34 
 
 
566 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  26 
 
 
562 aa  140  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  27.52 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  27.52 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  27.52 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  25.21 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  27.19 
 
 
547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  27.19 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  23.48 
 
 
561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  24.29 
 
 
559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  26.85 
 
 
570 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  26.85 
 
 
570 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  28.12 
 
 
414 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  27.65 
 
 
578 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  25.05 
 
 
594 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  26.3 
 
 
540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  26.3 
 
 
540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  27.43 
 
 
578 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  27.21 
 
 
578 aa  120  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  26.93 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  26.54 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  25.54 
 
 
504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 
504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 
504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  28.52 
 
 
359 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  26.3 
 
 
586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  24.88 
 
 
579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 
558 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  23.83 
 
 
563 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  24.47 
 
 
487 aa  107  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  25.12 
 
 
558 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  22.75 
 
 
563 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  23.37 
 
 
509 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  23.68 
 
 
629 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  24.12 
 
 
642 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  25.71 
 
 
566 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  24.63 
 
 
587 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  24.63 
 
 
587 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  24.2 
 
 
580 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  22.82 
 
 
573 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  23.24 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  22.6 
 
 
573 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  25.08 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  27.2 
 
 
258 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 
575 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  22.05 
 
 
548 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  21.37 
 
 
548 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  22.43 
 
 
586 aa  64.3  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  35.8 
 
 
108 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0468a  hypothetical protein  43.75 
 
 
72 aa  55.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1698  hypothetical protein  43.75 
 
 
72 aa  55.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.358515  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0284  hypothetical protein  47.27 
 
 
125 aa  53.9  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0264692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  29.59 
 
 
171 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  21.84 
 
 
536 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  21.91 
 
 
539 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  22.29 
 
 
417 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  24.56 
 
 
604 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  24.56 
 
 
604 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  21.6 
 
 
507 aa  47  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04630  hypothetical protein  18.11 
 
 
534 aa  47  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.27665  hitchhiker  0.000000619926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>