150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1742 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  100 
 
 		 531 aa  1092    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  100 
 
 		 531 aa  1092    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  50.75 
 
 		 534 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  50.94 
 
 		 534 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  50.94 
 
 		 534 aa  547  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  48.01 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  48.01 
 
 		 536 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  48.01 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  46.49 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  46.3 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  46.3 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  44.84 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  47.26 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  47.94 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  42.31 
 
 		 534 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  75.19 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  47.34 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 		 544 aa  313  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 		 544 aa  313  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  35.06 
 
 		 541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  41.94 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  32.9 
 
 		 537 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  28.69 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  28.51 
 
 		 560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  28.69 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  28.51 
 
 		 560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  28.69 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  28.71 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  47.57 
 
 		 272 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  26.97 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  26.97 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  26.97 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  26.97 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  26.97 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  26.68 
 
 		 552 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 560 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  26.68 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  26.76 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  26.76 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  26.76 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  26.76 
 
 		 552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  26.76 
 
 		 552 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  26.56 
 
 		 552 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  26.56 
 
 		 552 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  26.35 
 
 		 552 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  26.2 
 
 		 552 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  26.56 
 
 		 552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  26.56 
 
 		 552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  29.81 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  22.28 
 
 		 572 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  22.28 
 
 		 572 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2828  hypothetical protein  51.65 
 
 		 101 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0550197  normal  0.193636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  23.48 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  23.48 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  23.48 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  23.48 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  23.48 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  23.48 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  23.14 
 
 		 537 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  23.14 
 
 		 537 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  20.91 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  21.82 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  21.82 
 
 		 596 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  21.82 
 
 		 596 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  21.61 
 
 		 561 aa  70.5  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2373  transposase  49.18 
 
 		 71 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  20.97 
 
 		 566 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  21.74 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  46.38 
 
 		 93 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  21.4 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  20.84 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  22.05 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  20.89 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1590  transposase  54.72 
 
 		 53 aa  60.1  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0577947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  23.65 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  23.65 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  23.65 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  23.65 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  23.65 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  17.26 
 
 		 562 aa  57  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  23.33 
 
 		 596 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  22.91 
 
 		 573 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  22.91 
 
 		 573 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  22.28 
 
 		 586 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  22.28 
 
 		 586 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  22.28 
 
 		 586 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>