72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1562 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0240  transposase IS4 family protein  79.92 
 
 
522 aa  896    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  100 
 
 
520 aa  1087    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  100 
 
 
520 aa  1087    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1456  transposase IS4 family protein  79.73 
 
 
522 aa  894    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  100 
 
 
520 aa  1087    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2142  transposase IS4 family protein  100 
 
 
520 aa  1087    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  34.4 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  28.68 
 
 
530 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1041  transposase IS4 family protein  24.49 
 
 
570 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0885  hypothetical protein  24.49 
 
 
570 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0267734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0277  transposase IS4 family protein  24.49 
 
 
570 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000194582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1290  transposase, IS4 family protein  78.08 
 
 
84 aa  127  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  25.68 
 
 
540 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  25.68 
 
 
540 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  25.5 
 
 
555 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  25.8 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  25.8 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  25.8 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  25.8 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 
586 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  24.32 
 
 
559 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  22.89 
 
 
586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  22.89 
 
 
586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  22.89 
 
 
586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  22.97 
 
 
532 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  22.97 
 
 
532 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  22.89 
 
 
586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  22.89 
 
 
586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  24.59 
 
 
566 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  24.05 
 
 
548 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  24.05 
 
 
547 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  23.78 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  25.32 
 
 
449 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  21.55 
 
 
604 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  21.55 
 
 
604 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  23.3 
 
 
561 aa  57.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  21.63 
 
 
526 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  22.1 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  22.1 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  22.1 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  24.03 
 
 
586 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  21.55 
 
 
604 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  31.86 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  20.76 
 
 
604 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  20.67 
 
 
587 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  20.67 
 
 
587 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  21.14 
 
 
604 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  23.99 
 
 
522 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  31.75 
 
 
596 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  20.57 
 
 
604 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  20.57 
 
 
604 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  20.57 
 
 
604 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  22.18 
 
 
575 aa  50.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  24.57 
 
 
594 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  20.57 
 
 
460 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1821  hypothetical protein  25.29 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  22.81 
 
 
596 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
544 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  25.62 
 
 
544 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  22.81 
 
 
596 aa  47  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  20.29 
 
 
603 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  22.81 
 
 
596 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  22.32 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  24.41 
 
 
570 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  24.41 
 
 
570 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  24.41 
 
 
570 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  24.41 
 
 
570 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  24.41 
 
 
570 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  22.77 
 
 
579 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  26.4 
 
 
558 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  29.41 
 
 
130 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  26.32 
 
 
578 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>