143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2325 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  100 
 
 
537 aa  1111    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  63.62 
 
 
544 aa  732    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  63.62 
 
 
544 aa  732    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  36.45 
 
 
534 aa  334  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  36.45 
 
 
534 aa  333  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  36.45 
 
 
534 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  35.57 
 
 
541 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  33.95 
 
 
545 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  33.82 
 
 
536 aa  296  8e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  32.9 
 
 
531 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  32.9 
 
 
531 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  34.01 
 
 
536 aa  292  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  34.01 
 
 
536 aa  292  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  33.64 
 
 
539 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  33.52 
 
 
539 aa  291  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  33.52 
 
 
539 aa  291  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  34.8 
 
 
507 aa  290  7e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  33.14 
 
 
534 aa  267  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  32.7 
 
 
462 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  33.57 
 
 
417 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  30.33 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  30.33 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  30.33 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  30.33 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  30.33 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  29.53 
 
 
560 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  29.53 
 
 
560 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  29.56 
 
 
560 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  29.56 
 
 
560 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  29.56 
 
 
560 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
560 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
560 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
560 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
560 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
560 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
560 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  29.55 
 
 
560 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  29 
 
 
560 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  29.53 
 
 
552 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  28.91 
 
 
552 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  29.1 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  29.1 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  29.1 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  29.1 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  29.28 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  29.1 
 
 
552 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  28.91 
 
 
552 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  29.3 
 
 
374 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  28.91 
 
 
552 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  28.91 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  28.71 
 
 
552 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  29.04 
 
 
552 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  34.98 
 
 
400 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  34.01 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  31.38 
 
 
402 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  26.46 
 
 
572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  26.46 
 
 
572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  25.92 
 
 
538 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  25.92 
 
 
538 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  25.92 
 
 
538 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  25.92 
 
 
538 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  25.92 
 
 
538 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  25.37 
 
 
538 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  23.98 
 
 
604 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  23.88 
 
 
604 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  23.67 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  23.67 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  23.67 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  23.27 
 
 
603 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  28.57 
 
 
537 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  28.57 
 
 
537 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  42.65 
 
 
93 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  24.05 
 
 
561 aa  63.9  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2237  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  24.9 
 
 
562 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  23.21 
 
 
562 aa  60.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2373  transposase  40 
 
 
71 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  24.69 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  22.99 
 
 
574 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  23.06 
 
 
460 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  22.99 
 
 
574 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  22.7 
 
 
596 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  22.91 
 
 
596 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3463  hypothetical protein  24.57 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  28.51 
 
 
596 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  20.27 
 
 
577 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0555  transposase, IS4  20.27 
 
 
577 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218237  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  20.27 
 
 
577 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  20.27 
 
 
577 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  20.27 
 
 
577 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3134  transposase, IS4  20.27 
 
 
577 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  23.66 
 
 
559 aa  54.3  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>