53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3464 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  527  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  89.61 
 
 
548 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  89.61 
 
 
547 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  88.89 
 
 
414 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  49.29 
 
 
559 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  91.3 
 
 
130 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3431  hypothetical protein  81.98 
 
 
147 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  30.82 
 
 
538 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  30.82 
 
 
538 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  30.82 
 
 
538 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  30.82 
 
 
538 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  30.07 
 
 
526 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  29.35 
 
 
532 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  29.35 
 
 
532 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  27.02 
 
 
561 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  25.87 
 
 
558 aa  82  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  25.87 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  27.2 
 
 
554 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
579 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  25.87 
 
 
540 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  27.53 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  25.17 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
555 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  25.78 
 
 
586 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  25.52 
 
 
540 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  26.28 
 
 
578 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  26.28 
 
 
578 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  26.28 
 
 
578 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  26.69 
 
 
562 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  26.37 
 
 
562 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  26.06 
 
 
562 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  22.81 
 
 
566 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  19.07 
 
 
510 aa  53.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  24.92 
 
 
562 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  27.73 
 
 
511 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  27.73 
 
 
511 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  24.35 
 
 
548 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  24.35 
 
 
548 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  24.35 
 
 
548 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 
508 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  23.74 
 
 
522 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  24.32 
 
 
508 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  21.51 
 
 
504 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  21.51 
 
 
504 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  21.51 
 
 
504 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  27.52 
 
 
566 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  37.31 
 
 
642 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  24.58 
 
 
596 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0284  hypothetical protein  23.58 
 
 
125 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0264692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  24.58 
 
 
596 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  24.58 
 
 
596 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  22.99 
 
 
513 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  25.94 
 
 
487 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>