63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0284 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0284  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0264692  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  80.99 
 
 
359 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  46.23 
 
 
566 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  36.63 
 
 
561 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  35.92 
 
 
526 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  39.05 
 
 
558 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  33.98 
 
 
532 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  33.98 
 
 
532 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  38.1 
 
 
558 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
596 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
596 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
596 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  31.3 
 
 
538 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  31.3 
 
 
538 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  31.3 
 
 
538 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  31.3 
 
 
538 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  47.27 
 
 
554 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  35.64 
 
 
586 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  35.64 
 
 
555 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  35.64 
 
 
540 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  36.63 
 
 
540 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 
510 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  31.46 
 
 
545 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  31.46 
 
 
545 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  31.46 
 
 
545 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  31.46 
 
 
545 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  31.46 
 
 
545 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  26.21 
 
 
547 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  26.21 
 
 
548 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  26.21 
 
 
414 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  34.34 
 
 
586 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  34.34 
 
 
586 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  34.34 
 
 
586 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  34.34 
 
 
586 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  34.34 
 
 
586 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  35.51 
 
 
578 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  41.94 
 
 
275 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  35.51 
 
 
578 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  35.51 
 
 
578 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
563 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  39.13 
 
 
509 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
487 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  39.13 
 
 
563 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  25.24 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  23.58 
 
 
258 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
562 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  40 
 
 
573 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  40 
 
 
573 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  32.67 
 
 
566 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  28.57 
 
 
504 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
504 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
504 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  47.5 
 
 
570 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  47.5 
 
 
570 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  45 
 
 
580 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  47.5 
 
 
570 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  47.5 
 
 
570 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  47.5 
 
 
570 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  29.46 
 
 
548 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  29.46 
 
 
548 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  29.46 
 
 
548 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 
562 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  28.89 
 
 
539 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>