217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0463 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
350 aa  709    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  58.76 
 
 
355 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  57.68 
 
 
355 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  55.68 
 
 
371 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  55.71 
 
 
355 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.69 
 
 
359 aa  351  8.999999999999999e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.71 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.32 
 
 
357 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.28 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.66 
 
 
353 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  36.15 
 
 
355 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.3 
 
 
375 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.1 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  36.11 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.12 
 
 
360 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  37.46 
 
 
378 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.94 
 
 
771 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.59 
 
 
792 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.24 
 
 
371 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.55 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.59 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.62 
 
 
337 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.44 
 
 
335 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  32.01 
 
 
351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.11 
 
 
357 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.32 
 
 
444 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.73 
 
 
384 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.75 
 
 
334 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
318 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.93 
 
 
336 aa  142  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.33 
 
 
320 aa  142  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.17 
 
 
401 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.21 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
333 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.61 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33 
 
 
332 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
345 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.12 
 
 
340 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  27.93 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.13 
 
 
338 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.09 
 
 
345 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
336 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.99 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.71 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.69 
 
 
325 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
331 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.72 
 
 
330 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.66 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.78 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.39 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.66 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.18 
 
 
375 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.58 
 
 
339 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.54 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.79 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.25 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.82 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.25 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.58 
 
 
339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.8 
 
 
347 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.88 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.74 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.91 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.74 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.84 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.24 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.74 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.53 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.49 
 
 
335 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.69 
 
 
337 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.98 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.41 
 
 
357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.03 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.11 
 
 
343 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.56 
 
 
331 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.53 
 
 
327 aa  125  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.03 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.03 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0773  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.4 
 
 
330 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
328 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.13 
 
 
333 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
328 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
328 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
328 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
328 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.18 
 
 
375 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
328 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32 
 
 
335 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  30.07 
 
 
328 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
328 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.19 
 
 
333 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.93 
 
 
341 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.93 
 
 
329 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.7 
 
 
337 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.64 
 
 
331 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>