217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3001 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
444 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.23 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.42 
 
 
360 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 
378 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.25 
 
 
792 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.1 
 
 
371 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 
355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.21 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.02 
 
 
379 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.51 
 
 
361 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.51 
 
 
378 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.7 
 
 
374 aa  169  8e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.25 
 
 
353 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.86 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.69 
 
 
375 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.62 
 
 
357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.52 
 
 
318 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.35 
 
 
381 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.8 
 
 
346 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.28 
 
 
355 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 
324 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.72 
 
 
360 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.54 
 
 
771 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  31.33 
 
 
371 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.32 
 
 
350 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.82 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.92 
 
 
359 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.45 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.45 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.46 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  28.84 
 
 
355 aa  126  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  30.81 
 
 
355 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.78 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.62 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  25.12 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.16 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.15 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.26 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.81 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.91 
 
 
372 aa  110  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.22 
 
 
339 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0682  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.44 
 
 
369 aa  109  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00304258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.03 
 
 
337 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.89 
 
 
349 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.84 
 
 
346 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.14 
 
 
331 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.07 
 
 
357 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.11 
 
 
363 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.72 
 
 
339 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.96 
 
 
385 aa  106  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.08 
 
 
331 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.11 
 
 
345 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.56 
 
 
335 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  25.96 
 
 
336 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.37 
 
 
347 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.83 
 
 
320 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
361 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  25.35 
 
 
349 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.06 
 
 
335 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.99 
 
 
330 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.28 
 
 
375 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.34 
 
 
334 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.2 
 
 
333 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
336 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.46 
 
 
334 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.6 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.36 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.86 
 
 
325 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.75 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.46 
 
 
333 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.73 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 
333 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.17 
 
 
372 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.86 
 
 
325 aa  97.1  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.08 
 
 
357 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  34.04 
 
 
349 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0649  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.31 
 
 
332 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.52 
 
 
335 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.52 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0489  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.31 
 
 
332 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.75 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.89 
 
 
348 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.96 
 
 
346 aa  95.5  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.95 
 
 
332 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.73 
 
 
333 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.61 
 
 
331 aa  94.4  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.17 
 
 
339 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.02 
 
 
328 aa  93.2  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.02 
 
 
328 aa  93.2  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.18 
 
 
355 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.02 
 
 
328 aa  93.2  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.43 
 
 
305 aa  93.2  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.6 
 
 
329 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.66 
 
 
339 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.01 
 
 
335 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.71 
 
 
335 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.39 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.66 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  25.93 
 
 
355 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.7 
 
 
340 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>