217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2347 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
355 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  69.86 
 
 
353 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  57.46 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  55.93 
 
 
375 aa  358  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  56.23 
 
 
348 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.66 
 
 
361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.58 
 
 
360 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.57 
 
 
357 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.66 
 
 
384 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.09 
 
 
381 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.38 
 
 
792 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.21 
 
 
401 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.38 
 
 
444 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  39.23 
 
 
324 aa  185  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.31 
 
 
318 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.15 
 
 
350 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 
378 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  39.29 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.3 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.79 
 
 
379 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.64 
 
 
355 aa  169  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  36.28 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.67 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.22 
 
 
378 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  34.94 
 
 
322 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.37 
 
 
374 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.86 
 
 
335 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.41 
 
 
371 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  30.92 
 
 
355 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.98 
 
 
337 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.34 
 
 
328 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.31 
 
 
325 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.54 
 
 
333 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.85 
 
 
771 aa  149  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.05 
 
 
338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.24 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.24 
 
 
341 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.24 
 
 
337 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.65 
 
 
341 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.81 
 
 
331 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.2 
 
 
337 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.47 
 
 
345 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.59 
 
 
338 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.21 
 
 
333 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.77 
 
 
338 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 
351 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.87 
 
 
330 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.13 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.09 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.51 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.11 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.11 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.31 
 
 
338 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  38.11 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.67 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.11 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.07 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.11 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.26 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.29 
 
 
349 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.49 
 
 
332 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  38.7 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.95 
 
 
331 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.79 
 
 
328 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.79 
 
 
328 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.79 
 
 
328 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.33 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.89 
 
 
353 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.79 
 
 
328 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.68 
 
 
337 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.89 
 
 
343 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.29 
 
 
337 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.22 
 
 
375 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.67 
 
 
339 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3155  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.31 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.07 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.79 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.79 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.33 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.21 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.04 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.91 
 
 
331 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.36 
 
 
341 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.72 
 
 
335 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.41 
 
 
331 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.83 
 
 
430 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.26 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.26 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.67 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.26 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.61 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.66 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.88 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.64 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.57 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.69 
 
 
335 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.34 
 
 
345 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.76 
 
 
327 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>