217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0848 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
348 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  94.25 
 
 
375 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  61.1 
 
 
360 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  56.23 
 
 
355 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.04 
 
 
353 aa  342  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.15 
 
 
361 aa  322  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.76 
 
 
360 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.95 
 
 
357 aa  238  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  44.34 
 
 
378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.37 
 
 
379 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.77 
 
 
384 aa  205  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.46 
 
 
378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.18 
 
 
792 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.31 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.26 
 
 
381 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  38.64 
 
 
355 aa  193  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  39.69 
 
 
324 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.84 
 
 
371 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
350 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.28 
 
 
346 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.51 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.24 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.86 
 
 
444 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.48 
 
 
355 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.03 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  34.08 
 
 
355 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  34.27 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.69 
 
 
363 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.03 
 
 
325 aa  165  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.71 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  38.06 
 
 
322 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.46 
 
 
357 aa  159  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.96 
 
 
331 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.84 
 
 
349 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.15 
 
 
341 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.78 
 
 
338 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.46 
 
 
337 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
330 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.61 
 
 
328 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.73 
 
 
326 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.23 
 
 
771 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.59 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.8 
 
 
374 aa  153  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.2 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.08 
 
 
331 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.78 
 
 
375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.15 
 
 
337 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.45 
 
 
333 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.63 
 
 
385 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.49 
 
 
338 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  34.24 
 
 
364 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.18 
 
 
341 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  32.48 
 
 
351 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.02 
 
 
336 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.85 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.81 
 
 
331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.78 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.13 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.45 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.45 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.97 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.24 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.42 
 
 
331 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.85 
 
 
339 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.41 
 
 
333 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.87 
 
 
320 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.96 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.89 
 
 
341 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.6 
 
 
372 aa  146  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.79 
 
 
335 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
375 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.68 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.96 
 
 
332 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.62 
 
 
337 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.12 
 
 
335 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.69 
 
 
336 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.16 
 
 
329 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.81 
 
 
333 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.33 
 
 
330 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.67 
 
 
340 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.14 
 
 
333 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.12 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.59 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.7 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.17 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  41.13 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.28 
 
 
331 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.45 
 
 
339 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34 
 
 
335 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.41 
 
 
335 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.28 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.08 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0773  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.3 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  34.38 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.28 
 
 
338 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.38 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>