217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3208 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
333 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.59 
 
 
335 aa  288  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.44 
 
 
349 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.09 
 
 
335 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.72 
 
 
338 aa  245  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.48 
 
 
372 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2807  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.05 
 
 
349 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0758869  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.51 
 
 
335 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.03 
 
 
366 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.64 
 
 
353 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.73 
 
 
339 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.31 
 
 
331 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.73 
 
 
339 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.42 
 
 
339 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.48 
 
 
349 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.47 
 
 
332 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  44.62 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.9 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.45 
 
 
333 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.6 
 
 
337 aa  232  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.32 
 
 
330 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.91 
 
 
330 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.48 
 
 
334 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.38 
 
 
335 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.09 
 
 
348 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3570  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.7 
 
 
338 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  hitchhiker  0.00823889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.84 
 
 
333 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.62 
 
 
336 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.08 
 
 
338 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.65 
 
 
332 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.22 
 
 
335 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.22 
 
 
335 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.22 
 
 
335 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.65 
 
 
337 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
328 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.7 
 
 
335 aa  222  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  45.71 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.64 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.84 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.88 
 
 
338 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.4 
 
 
328 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5876  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.92 
 
 
342 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154675  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.63 
 
 
331 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.9 
 
 
327 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2273  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.43 
 
 
284 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00104857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.94 
 
 
333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2569  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.63 
 
 
342 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367774  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.67 
 
 
325 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.36 
 
 
385 aa  216  5e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.37 
 
 
336 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.67 
 
 
325 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.48 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  0.105558 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0569  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.43 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00131505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1046  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.43 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000972392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0927  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.43 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0930  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.43 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.918202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.43 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.65 
 
 
331 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0538  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.01 
 
 
338 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.51 
 
 
339 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.18 
 
 
375 aa  215  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.45 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0751  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.33 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43067  normal  0.485702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1933  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.63 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313008  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.48 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2545  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.63 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0393556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.5 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.67 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.06 
 
 
416 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.04 
 
 
342 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.95 
 
 
331 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0742  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.69 
 
 
346 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.04 
 
 
342 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.82 
 
 
341 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.04 
 
 
341 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  42.12 
 
 
329 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.97 
 
 
326 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0312  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.05 
 
 
366 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.07 
 
 
363 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
328 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
328 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.77 
 
 
338 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
328 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.89 
 
 
325 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.18 
 
 
336 aa  208  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.89 
 
 
325 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  39.94 
 
 
361 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.89 
 
 
325 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.89 
 
 
325 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.29 
 
 
372 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.79 
 
 
325 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.31 
 
 
305 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.41 
 
 
345 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.64 
 
 
337 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>