217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2613 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
378 aa  685    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  95.79 
 
 
379 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  96.07 
 
 
378 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  73.35 
 
 
371 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.11 
 
 
401 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.57 
 
 
348 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.82 
 
 
375 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.16 
 
 
360 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.38 
 
 
360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.9 
 
 
357 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.22 
 
 
444 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.74 
 
 
381 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.72 
 
 
355 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.82 
 
 
353 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.06 
 
 
384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.74 
 
 
361 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.76 
 
 
792 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 
355 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.63 
 
 
350 aa  178  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.38 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.41 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  35.63 
 
 
355 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.61 
 
 
771 aa  167  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  33.24 
 
 
371 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.13 
 
 
325 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.01 
 
 
359 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.47 
 
 
338 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  30.21 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.89 
 
 
374 aa  153  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 
324 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.71 
 
 
385 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.72 
 
 
328 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.02 
 
 
332 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  38.18 
 
 
343 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.35 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  33.02 
 
 
361 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  35.74 
 
 
322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.86 
 
 
357 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.7 
 
 
329 aa  146  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.67 
 
 
372 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.58 
 
 
337 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.46 
 
 
338 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32 
 
 
335 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.2 
 
 
331 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.08 
 
 
320 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.14 
 
 
326 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.36 
 
 
353 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.86 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.27 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.44 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.69 
 
 
327 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.14 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.42 
 
 
333 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.17 
 
 
335 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.34 
 
 
328 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.34 
 
 
328 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.34 
 
 
328 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.51 
 
 
335 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.53 
 
 
331 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.54 
 
 
337 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.65 
 
 
333 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.5 
 
 
327 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.94 
 
 
332 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.26 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.79 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.26 
 
 
335 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.23 
 
 
335 aa  136  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.77 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.21 
 
 
305 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  39.54 
 
 
333 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.79 
 
 
338 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.78 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.08 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.74 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.23 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.29 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.74 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.1 
 
 
335 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.57 
 
 
331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.94 
 
 
335 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.91 
 
 
338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.77 
 
 
339 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.71 
 
 
336 aa  133  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  33.89 
 
 
349 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.57 
 
 
343 aa  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.3 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.01 
 
 
346 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.11 
 
 
430 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.77 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.46 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.66 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0649  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.44 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0489  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.44 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0682  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.89 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00304258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.81 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.83 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.74 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.19 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>