217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2969 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
327 aa  634    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  93.88 
 
 
327 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  82.26 
 
 
327 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  68.83 
 
 
326 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  68.15 
 
 
337 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.27 
 
 
337 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  64.95 
 
 
332 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.48 
 
 
338 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.35 
 
 
340 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.44 
 
 
345 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.85 
 
 
338 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.29 
 
 
335 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.84 
 
 
343 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.38 
 
 
329 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.5 
 
 
331 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.89 
 
 
333 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  45.08 
 
 
343 aa  245  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.04 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.04 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.06 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.08 
 
 
337 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.04 
 
 
341 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.68 
 
 
343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.5 
 
 
342 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.15 
 
 
345 aa  228  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.15 
 
 
346 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.06 
 
 
327 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.21 
 
 
347 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.94 
 
 
332 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.14 
 
 
357 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.36 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.02 
 
 
339 aa  216  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.85 
 
 
332 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.37 
 
 
328 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.08 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  44.58 
 
 
341 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.1 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.75 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.75 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.28 
 
 
335 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.75 
 
 
339 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.02 
 
 
341 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42 
 
 
353 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.93 
 
 
335 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.93 
 
 
335 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.92 
 
 
336 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.25 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  41.64 
 
 
329 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.23 
 
 
330 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.06 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.27 
 
 
771 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.69 
 
 
336 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.76 
 
 
335 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.16 
 
 
327 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.8 
 
 
335 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.28 
 
 
335 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.32 
 
 
339 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.37 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.55 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.97 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.54 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.12 
 
 
335 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.06 
 
 
331 aa  145  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.3 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.44 
 
 
333 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.1 
 
 
333 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.84 
 
 
337 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2126  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.04 
 
 
343 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0289041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.25 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.74 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.38 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.85 
 
 
338 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.33 
 
 
348 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.2 
 
 
326 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.87 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  40.07 
 
 
355 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.55 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  38.93 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.62 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.23 
 
 
325 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.26 
 
 
346 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.24 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.01 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.23 
 
 
325 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.98 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.1 
 
 
346 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.08 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
338 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0538  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.53 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.31 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  40.4 
 
 
378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.4 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.64 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.04 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.31 
 
 
325 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.54 
 
 
350 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.05 
 
 
792 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.18 
 
 
325 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>