217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0624 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
342 aa  665    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.52 
 
 
333 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.63 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.84 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.5 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.43 
 
 
337 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.06 
 
 
345 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.5 
 
 
327 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.77 
 
 
337 aa  249  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.21 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.9 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.8 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.96 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.96 
 
 
341 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.49 
 
 
327 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50 
 
 
326 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.85 
 
 
337 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.87 
 
 
338 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.34 
 
 
343 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.92 
 
 
341 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.95 
 
 
332 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.2 
 
 
332 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.41 
 
 
327 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.11 
 
 
347 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.47 
 
 
332 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.97 
 
 
346 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.34 
 
 
340 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.3 
 
 
343 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  42.47 
 
 
343 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.23 
 
 
357 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  47.21 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.64 
 
 
345 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.23 
 
 
335 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.02 
 
 
332 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.29 
 
 
339 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.41 
 
 
315 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.22 
 
 
331 aa  159  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.22 
 
 
360 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.04 
 
 
337 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.3 
 
 
335 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.84 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.14 
 
 
336 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.38 
 
 
353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.13 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.98 
 
 
335 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.06 
 
 
335 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.3 
 
 
357 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.69 
 
 
335 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.97 
 
 
326 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.64 
 
 
331 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.33 
 
 
330 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.93 
 
 
372 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.29 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.41 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  37.83 
 
 
355 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.01 
 
 
335 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.7 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.95 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.12 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.95 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.12 
 
 
328 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.12 
 
 
328 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.95 
 
 
325 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.33 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.33 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  34.33 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.69 
 
 
305 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.12 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
341 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.21 
 
 
366 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.82 
 
 
328 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.23 
 
 
792 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
339 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.69 
 
 
339 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
337 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.98 
 
 
332 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.54 
 
 
327 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.46 
 
 
325 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.58 
 
 
353 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.29 
 
 
335 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.93 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.21 
 
 
375 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.22 
 
 
335 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.99 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3155  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.01 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.6 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.22 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.56 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.86 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.38 
 
 
381 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  35.17 
 
 
349 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.92 
 
 
331 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.58 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  35.94 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.93 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.88 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.88 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.15 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.69 
 
 
371 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>