217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1692 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
345 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  65.37 
 
 
337 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  65.07 
 
 
335 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  59.64 
 
 
338 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  61.72 
 
 
338 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  62.09 
 
 
340 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  62.94 
 
 
343 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.69 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.74 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.05 
 
 
327 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.27 
 
 
343 aa  292  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.48 
 
 
327 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.52 
 
 
326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.79 
 
 
347 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.66 
 
 
331 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.62 
 
 
346 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.53 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  55.93 
 
 
332 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.12 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.55 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.09 
 
 
342 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.86 
 
 
341 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.86 
 
 
341 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.77 
 
 
339 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.33 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  40.77 
 
 
343 aa  238  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.33 
 
 
328 aa  228  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.82 
 
 
337 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.21 
 
 
329 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.08 
 
 
335 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.38 
 
 
332 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.97 
 
 
327 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.08 
 
 
332 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  40.88 
 
 
341 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.71 
 
 
332 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.9 
 
 
315 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.33 
 
 
335 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
337 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.47 
 
 
337 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.26 
 
 
339 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.93 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.35 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.67 
 
 
335 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.67 
 
 
335 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.47 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.53 
 
 
331 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.8 
 
 
335 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.25 
 
 
341 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.35 
 
 
339 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.34 
 
 
360 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.69 
 
 
336 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.62 
 
 
375 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.22 
 
 
327 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.28 
 
 
771 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.71 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.23 
 
 
338 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.43 
 
 
349 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.58 
 
 
372 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.06 
 
 
335 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.15 
 
 
366 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.67 
 
 
335 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.25 
 
 
335 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.58 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.63 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  33.02 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.89 
 
 
330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.79 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.13 
 
 
335 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  40.59 
 
 
333 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.92 
 
 
337 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.7 
 
 
331 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 
361 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.79 
 
 
358 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.47 
 
 
331 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 
355 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.78 
 
 
335 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.36 
 
 
381 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.77 
 
 
340 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.69 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.32 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.82 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.04 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.55 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.35 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.25 
 
 
792 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.75 
 
 
336 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.71 
 
 
338 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3570  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.46 
 
 
338 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  hitchhiker  0.00823889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.06 
 
 
332 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0682  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
369 aa  138  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00304258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.14 
 
 
353 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.16 
 
 
332 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.11 
 
 
326 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.8 
 
 
349 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.28 
 
 
355 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.68 
 
 
333 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  31.95 
 
 
355 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.84 
 
 
345 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.28 
 
 
372 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.4 
 
 
320 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>