217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2485 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
358 aa  685    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  59.82 
 
 
348 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.75 
 
 
343 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.14 
 
 
338 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46 
 
 
338 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.75 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3570  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.35 
 
 
338 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  hitchhiker  0.00823889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.92 
 
 
349 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0538  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.31 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2641  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.96 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.31 
 
 
338 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.161376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.77 
 
 
366 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.87 
 
 
430 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3155  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.77 
 
 
355 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5876  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.37 
 
 
342 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154675  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2569  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.54 
 
 
342 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367774  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1933  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.83 
 
 
342 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2545  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.83 
 
 
342 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0393556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0766  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50 
 
 
338 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.983707  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0569  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.79 
 
 
376 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00131505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1046  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.79 
 
 
376 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000972392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0927  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.79 
 
 
376 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0930  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.79 
 
 
376 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.918202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.79 
 
 
376 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.79 
 
 
416 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.25 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.39 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.25 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.85 
 
 
335 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0742  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.18 
 
 
346 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.82 
 
 
331 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  44.52 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0751  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.49 
 
 
342 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43067  normal  0.485702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.34 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.86 
 
 
335 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.07 
 
 
339 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  42.48 
 
 
329 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.02 
 
 
372 aa  193  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2807  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.4 
 
 
349 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0758869  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.71 
 
 
335 aa  192  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.35 
 
 
330 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.24 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.88 
 
 
349 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  0.105558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
338 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.15 
 
 
335 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.15 
 
 
335 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2273  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.35 
 
 
284 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00104857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.86 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
336 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.76 
 
 
339 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2564  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.33 
 
 
347 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0664726  decreased coverage  0.00223981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.64 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.47 
 
 
335 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.34 
 
 
339 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.83 
 
 
337 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.64 
 
 
333 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.63 
 
 
339 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.1 
 
 
338 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.34 
 
 
339 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.78 
 
 
385 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.44 
 
 
375 aa  176  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.78 
 
 
339 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.3 
 
 
331 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.31 
 
 
363 aa  176  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.82 
 
 
333 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.11 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.66 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.95 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.76 
 
 
334 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.74 
 
 
337 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.28 
 
 
333 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.53 
 
 
345 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
333 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.67 
 
 
331 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.48 
 
 
332 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.89 
 
 
346 aa  169  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.08 
 
 
335 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.3 
 
 
331 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.77 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
332 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.56 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.73 
 
 
331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.18 
 
 
328 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.18 
 
 
328 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  34.31 
 
 
349 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.18 
 
 
328 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.71 
 
 
328 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.46 
 
 
328 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.12 
 
 
341 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.4 
 
 
327 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.18 
 
 
328 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.18 
 
 
328 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.43 
 
 
328 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  37.18 
 
 
328 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0312  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.15 
 
 
366 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.07 
 
 
336 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.07 
 
 
330 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.89 
 
 
335 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.54 
 
 
325 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
340 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>