217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2564 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2564  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
347 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0664726  decreased coverage  0.00223981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  65.4 
 
 
338 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  64.81 
 
 
338 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3570  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  58.91 
 
 
338 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  hitchhiker  0.00823889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2641  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  61.61 
 
 
346 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3155  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  57.88 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  56.36 
 
 
430 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.55 
 
 
338 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.33 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.93 
 
 
349 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.95 
 
 
348 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.84 
 
 
349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.83 
 
 
366 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.33 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.42 
 
 
372 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.94 
 
 
335 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.33 
 
 
333 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.26 
 
 
337 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.94 
 
 
339 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.6 
 
 
339 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.6 
 
 
339 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  44.14 
 
 
333 aa  205  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.37 
 
 
333 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2807  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.93 
 
 
349 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0758869  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.71 
 
 
331 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.2 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.2 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.21 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  0.105558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.86 
 
 
335 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1933  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.67 
 
 
342 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2545  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.67 
 
 
342 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0393556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.85 
 
 
330 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
328 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
328 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.39 
 
 
335 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
328 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  43.05 
 
 
328 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.35 
 
 
338 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
328 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
328 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
328 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.38 
 
 
339 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5876  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.34 
 
 
342 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154675  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.86 
 
 
328 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2569  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.34 
 
 
342 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367774  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
328 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0751  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.01 
 
 
342 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43067  normal  0.485702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.01 
 
 
342 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.06 
 
 
331 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  42.68 
 
 
329 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.67 
 
 
335 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.68 
 
 
342 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.84 
 
 
335 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0312  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.23 
 
 
366 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.24 
 
 
331 aa  189  9e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.94 
 
 
353 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0538  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.77 
 
 
338 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.63 
 
 
346 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.75 
 
 
337 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  35.17 
 
 
349 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.76 
 
 
332 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.78 
 
 
375 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.55 
 
 
372 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.94 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.84 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.86 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.84 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.84 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.3 
 
 
337 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.66 
 
 
341 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.52 
 
 
335 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.55 
 
 
325 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.56 
 
 
336 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.96 
 
 
332 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.45 
 
 
363 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.06 
 
 
385 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.16 
 
 
333 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.98 
 
 
336 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.86 
 
 
331 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.27 
 
 
339 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.88 
 
 
333 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.16 
 
 
333 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.61 
 
 
334 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.18 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.22 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.161376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.86 
 
 
331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.42 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.09 
 
 
325 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.09 
 
 
325 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.95 
 
 
339 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.09 
 
 
325 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0766  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.32 
 
 
338 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.983707  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43 
 
 
325 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.78 
 
 
338 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.16 
 
 
320 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0569  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
376 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00131505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1046  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
376 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000972392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0927  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
376 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0370825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0930  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
376 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.918202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.01 
 
 
376 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>