217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2094 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
329 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  64.83 
 
 
333 aa  407  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  63.64 
 
 
328 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  65.55 
 
 
332 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  65.24 
 
 
332 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  69.6 
 
 
332 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  64.94 
 
 
337 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.83 
 
 
331 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.38 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.38 
 
 
327 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.66 
 
 
335 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.87 
 
 
337 aa  248  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.46 
 
 
327 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.81 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.24 
 
 
338 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.54 
 
 
326 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.48 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.21 
 
 
345 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.25 
 
 
337 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  42.95 
 
 
343 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.9 
 
 
342 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.77 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.44 
 
 
341 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.37 
 
 
345 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.76 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.76 
 
 
335 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  44.33 
 
 
341 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.99 
 
 
315 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.65 
 
 
343 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.4 
 
 
347 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.07 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.16 
 
 
327 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.67 
 
 
339 aa  192  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.92 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.19 
 
 
331 aa  165  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.12 
 
 
339 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.49 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.81 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.44 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.96 
 
 
328 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.83 
 
 
339 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.25 
 
 
336 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.96 
 
 
328 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.93 
 
 
335 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.65 
 
 
331 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.51 
 
 
339 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.87 
 
 
336 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.65 
 
 
328 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.65 
 
 
328 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.65 
 
 
328 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.07 
 
 
337 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.22 
 
 
328 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.19 
 
 
339 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.22 
 
 
328 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.22 
 
 
328 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.72 
 
 
331 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.94 
 
 
335 aa  158  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.74 
 
 
335 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.35 
 
 
328 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.35 
 
 
328 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.65 
 
 
328 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  37.35 
 
 
328 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.82 
 
 
330 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.7 
 
 
325 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.7 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.57 
 
 
366 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.39 
 
 
325 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.39 
 
 
325 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.99 
 
 
331 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.84 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.08 
 
 
325 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.53 
 
 
375 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.86 
 
 
357 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.86 
 
 
372 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.22 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.09 
 
 
335 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.62 
 
 
335 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.09 
 
 
335 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.14 
 
 
336 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.94 
 
 
346 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.61 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.86 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.58 
 
 
361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.87 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.07 
 
 
333 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.69 
 
 
330 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.44 
 
 
327 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.16 
 
 
333 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  43.06 
 
 
378 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.67 
 
 
331 aa  145  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.61 
 
 
371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  38.38 
 
 
355 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.42 
 
 
379 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.96 
 
 
349 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.7 
 
 
332 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.41 
 
 
334 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.02 
 
 
338 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.87 
 
 
360 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>