217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3028 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
361 aa  722    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.34 
 
 
360 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.38 
 
 
353 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  51.66 
 
 
355 aa  332  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.7 
 
 
360 aa  322  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.15 
 
 
348 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.28 
 
 
375 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.11 
 
 
357 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.08 
 
 
792 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.38 
 
 
325 aa  196  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.28 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.73 
 
 
401 aa  182  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.96 
 
 
318 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.64 
 
 
381 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  36.71 
 
 
355 aa  180  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  40.07 
 
 
378 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.51 
 
 
444 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.66 
 
 
384 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.02 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  35 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.87 
 
 
378 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.47 
 
 
359 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.97 
 
 
371 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  35.83 
 
 
371 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.76 
 
 
355 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.16 
 
 
340 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.05 
 
 
338 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  36.5 
 
 
322 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  38.46 
 
 
324 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.74 
 
 
338 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.21 
 
 
333 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 
351 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.02 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.29 
 
 
335 aa  153  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.54 
 
 
335 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.54 
 
 
335 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.24 
 
 
333 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.85 
 
 
346 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.03 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.93 
 
 
366 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.54 
 
 
335 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.57 
 
 
346 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.62 
 
 
357 aa  149  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  32.72 
 
 
364 aa  149  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.88 
 
 
328 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.64 
 
 
349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.37 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.85 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.44 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.14 
 
 
337 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.27 
 
 
338 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.67 
 
 
331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.81 
 
 
353 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33 
 
 
335 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.18 
 
 
329 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.64 
 
 
326 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.53 
 
 
339 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.05 
 
 
339 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.1 
 
 
375 aa  143  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.06 
 
 
355 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.55 
 
 
338 aa  142  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.87 
 
 
337 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.84 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.84 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  34.84 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.79 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.84 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.84 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.92 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.26 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.84 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.58 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.64 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.72 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.17 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  32.67 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.84 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.35 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.73 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.26 
 
 
325 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.2 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.52 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.74 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3155  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.59 
 
 
355 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.52 
 
 
328 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.48 
 
 
349 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.6 
 
 
363 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.9 
 
 
336 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.73 
 
 
331 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.68 
 
 
328 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.68 
 
 
328 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.68 
 
 
328 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.48 
 
 
331 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.91 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.44 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.43 
 
 
771 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.41 
 
 
331 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2641  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.91 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>