217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3412 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
375 aa  749    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  94.25 
 
 
348 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  61.28 
 
 
360 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  55.93 
 
 
355 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.14 
 
 
353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.28 
 
 
361 aa  322  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.15 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.92 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  42.72 
 
 
378 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.39 
 
 
379 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.78 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.76 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.75 
 
 
381 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.63 
 
 
792 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.69 
 
 
325 aa  192  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.3 
 
 
350 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.29 
 
 
346 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  39.14 
 
 
324 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.39 
 
 
371 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  37.34 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.59 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.69 
 
 
444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.43 
 
 
401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 
355 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.12 
 
 
355 aa  176  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  33.43 
 
 
371 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.24 
 
 
359 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.54 
 
 
363 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.13 
 
 
357 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.51 
 
 
325 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.2 
 
 
325 aa  159  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 
322 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.92 
 
 
341 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.81 
 
 
337 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.09 
 
 
771 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.49 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.47 
 
 
375 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.51 
 
 
332 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.07 
 
 
331 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.19 
 
 
332 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.83 
 
 
374 aa  152  8e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.39 
 
 
331 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.48 
 
 
330 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.51 
 
 
328 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.93 
 
 
326 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.92 
 
 
349 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.14 
 
 
337 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.87 
 
 
335 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.9 
 
 
333 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.5 
 
 
341 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.36 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.28 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.36 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.34 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.19 
 
 
341 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 
351 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.24 
 
 
335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.13 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.68 
 
 
335 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.85 
 
 
332 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.38 
 
 
336 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.85 
 
 
332 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.83 
 
 
331 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.96 
 
 
337 aa  143  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.98 
 
 
341 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.03 
 
 
333 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.82 
 
 
335 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.99 
 
 
333 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.23 
 
 
335 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.98 
 
 
331 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.23 
 
 
335 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.67 
 
 
340 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.74 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.81 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.67 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.23 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.82 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.21 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.74 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.74 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.74 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.76 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.74 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  33.74 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.74 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.35 
 
 
333 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.35 
 
 
337 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.77 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.46 
 
 
334 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.95 
 
 
330 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.92 
 
 
327 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  32.12 
 
 
364 aa  139  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.06 
 
 
335 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.5 
 
 
333 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.55 
 
 
347 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.69 
 
 
337 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.67 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.13 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0773  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.9 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.305357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>