220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0926 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
324 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.39 
 
 
360 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  39.23 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.38 
 
 
792 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.56 
 
 
355 aa  188  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.33 
 
 
353 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.49 
 
 
350 aa  185  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.28 
 
 
360 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.69 
 
 
348 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.14 
 
 
375 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.46 
 
 
361 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.13 
 
 
346 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  33.14 
 
 
371 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  34.46 
 
 
355 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.28 
 
 
771 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.63 
 
 
444 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  38.83 
 
 
378 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  33.1 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.7 
 
 
384 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.36 
 
 
401 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.62 
 
 
379 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.37 
 
 
371 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.16 
 
 
359 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.63 
 
 
381 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.76 
 
 
357 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.25 
 
 
378 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
374 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.04 
 
 
334 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.07 
 
 
336 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.07 
 
 
327 aa  149  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.07 
 
 
335 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.07 
 
 
335 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.5 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.19 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.49 
 
 
333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.53 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.86 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.03 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.63 
 
 
333 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.33 
 
 
328 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.33 
 
 
328 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.33 
 
 
328 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.67 
 
 
331 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.82 
 
 
332 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.84 
 
 
353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
333 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.68 
 
 
330 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.61 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.9 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.57 
 
 
325 aa  139  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.68 
 
 
337 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.02 
 
 
330 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.43 
 
 
363 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.37 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.15 
 
 
339 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.8 
 
 
339 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.93 
 
 
328 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.8 
 
 
335 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.12 
 
 
337 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.1 
 
 
341 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.25 
 
 
349 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.12 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  30.21 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.8 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.84 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.79 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.27 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0773  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.79 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.03 
 
 
331 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.94 
 
 
337 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.33 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
331 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.44 
 
 
337 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.27 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.11 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.89 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.84 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.25 
 
 
333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.62 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0682  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.21 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00304258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.4 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.48 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  31.97 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.79 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.53 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.27 
 
 
338 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.25 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0926  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.15 
 
 
372 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.89 
 
 
385 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.11 
 
 
372 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.24 
 
 
345 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.23 
 
 
338 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2135  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.08 
 
 
353 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000208743  normal  0.172594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.62 
 
 
345 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  35.61 
 
 
333 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.76 
 
 
375 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.27 
 
 
339 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.97 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.19 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>