213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0158 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
375 aa  768    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.5 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.86 
 
 
771 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
792 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  34.08 
 
 
378 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.92 
 
 
346 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.34 
 
 
374 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.77 
 
 
378 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.63 
 
 
318 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.79 
 
 
379 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.43 
 
 
360 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  31.54 
 
 
355 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.28 
 
 
375 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.67 
 
 
381 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.53 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.43 
 
 
361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.6 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  30.22 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.12 
 
 
331 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.18 
 
 
350 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.62 
 
 
336 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.91 
 
 
353 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35 
 
 
353 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.93 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.91 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  28.8 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  30.14 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.53 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.14 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  30.46 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.95 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.93 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.14 
 
 
335 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  30.28 
 
 
329 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.92 
 
 
330 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.04 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.61 
 
 
335 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.57 
 
 
335 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.15 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.94 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.8 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  33.05 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.64 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.34 
 
 
333 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.84 
 
 
337 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.72 
 
 
357 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.55 
 
 
332 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.05 
 
 
334 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.35 
 
 
331 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.66 
 
 
331 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.64 
 
 
336 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.61 
 
 
337 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.47 
 
 
331 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.09 
 
 
385 aa  104  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.56 
 
 
327 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.25 
 
 
325 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.48 
 
 
375 aa  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  31.21 
 
 
361 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.09 
 
 
335 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.13 
 
 
337 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_002620  TC0682  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.52 
 
 
369 aa  102  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00304258  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.27 
 
 
334 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.39 
 
 
328 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.39 
 
 
328 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.39 
 
 
328 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.53 
 
 
335 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.23 
 
 
345 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.94 
 
 
328 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2600  lipid-A-disaccharide synthase  27.91 
 
 
356 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.97 
 
 
338 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.94 
 
 
328 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.29 
 
 
372 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.39 
 
 
328 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.18 
 
 
320 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.39 
 
 
328 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  29.39 
 
 
328 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.13 
 
 
335 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.39 
 
 
328 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.12 
 
 
372 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.67 
 
 
346 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.35 
 
 
326 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.31 
 
 
331 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.85 
 
 
305 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.79 
 
 
335 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.79 
 
 
335 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.12 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  33.23 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 
343 aa  99.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.99 
 
 
366 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30 
 
 
331 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0773  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.61 
 
 
330 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.13 
 
 
339 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.49 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.2 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.72 
 
 
349 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.13 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.85 
 
 
339 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.25 
 
 
335 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.66 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>