217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2600 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2600  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
356 aa  722    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347536  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0773  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.69 
 
 
330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0926  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50 
 
 
372 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2135  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.85 
 
 
353 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000208743  normal  0.172594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.55 
 
 
363 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.47 
 
 
334 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.31 
 
 
332 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.47 
 
 
333 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.17 
 
 
333 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.12 
 
 
360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.56 
 
 
331 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.92 
 
 
331 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.78 
 
 
336 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.92 
 
 
332 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.24 
 
 
333 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.6 
 
 
336 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
353 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.7 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.32 
 
 
357 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.1 
 
 
335 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.62 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.86 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.48 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.3 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.2 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.64 
 
 
792 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  29.94 
 
 
355 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.88 
 
 
350 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.72 
 
 
346 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.04 
 
 
330 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  35.44 
 
 
355 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.84 
 
 
325 aa  122  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  32.39 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.27 
 
 
337 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  30.56 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14760  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.03 
 
 
333 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  30.1 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.58 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  27.91 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.12 
 
 
355 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0649  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.93 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0489  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.93 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.11 
 
 
341 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.56 
 
 
341 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.46 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.3 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.65 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.65 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.55 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.46 
 
 
325 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.46 
 
 
325 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.56 
 
 
325 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.46 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.63 
 
 
341 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.48 
 
 
335 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.48 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.16 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2126  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.34 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0289041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.86 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.54 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.54 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.54 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.48 
 
 
339 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.92 
 
 
327 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.28 
 
 
341 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1782  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.17 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.62 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.51 
 
 
361 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.17 
 
 
339 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  31.99 
 
 
328 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  31.72 
 
 
351 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.22 
 
 
331 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.56 
 
 
335 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.57 
 
 
374 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.99 
 
 
328 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  33.92 
 
 
378 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
331 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.03 
 
 
342 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.79 
 
 
337 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.94 
 
 
348 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.7 
 
 
305 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.87 
 
 
360 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.1 
 
 
357 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.99 
 
 
337 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.31 
 
 
331 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  29.8 
 
 
361 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.39 
 
 
331 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.6 
 
 
333 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
335 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.94 
 
 
375 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.43 
 
 
334 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>