217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0230 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
340 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50 
 
 
334 aa  333  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.48 
 
 
336 aa  302  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.06 
 
 
355 aa  288  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.22 
 
 
353 aa  269  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.32 
 
 
357 aa  255  9e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.6 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  40.18 
 
 
364 aa  235  7e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  37.39 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.83 
 
 
355 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  35.33 
 
 
371 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.16 
 
 
361 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  32.8 
 
 
355 aa  159  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.33 
 
 
357 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.23 
 
 
353 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.12 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.4 
 
 
355 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.5 
 
 
318 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.86 
 
 
346 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.03 
 
 
359 aa  142  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.9 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.09 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.45 
 
 
336 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.64 
 
 
401 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.12 
 
 
350 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.94 
 
 
771 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.67 
 
 
348 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.67 
 
 
375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0777  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.51 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.38 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.38 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.06 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.49 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2135  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.35 
 
 
353 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000208743  normal  0.172594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  27.33 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.49 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  29.91 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.86 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  30.92 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  32.48 
 
 
322 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.5 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.24 
 
 
341 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.16 
 
 
335 aa  126  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.13 
 
 
792 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.62 
 
 
330 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.6 
 
 
339 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.89 
 
 
335 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.6 
 
 
339 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.6 
 
 
339 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.05 
 
 
320 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.9 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.23 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.08 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.67 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.9 
 
 
366 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.4 
 
 
379 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.08 
 
 
378 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.36 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
384 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.78 
 
 
349 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.04 
 
 
337 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.63 
 
 
325 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.69 
 
 
326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.63 
 
 
325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  27.05 
 
 
378 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.3 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.18 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.75 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.59 
 
 
333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.24 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.5 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.33 
 
 
331 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  29.41 
 
 
361 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.82 
 
 
325 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.82 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  30.38 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.33 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.12 
 
 
333 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.42 
 
 
325 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.61 
 
 
335 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.93 
 
 
371 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.44 
 
 
325 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.66 
 
 
327 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.57 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.26 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.8 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  28.39 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.13 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  26.69 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.37 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1023  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.95 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.07 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>