217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0485 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
359 aa  736    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.86 
 
 
355 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  50.57 
 
 
371 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.69 
 
 
350 aa  351  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  48.56 
 
 
355 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.85 
 
 
346 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  47.04 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.78 
 
 
360 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  37.75 
 
 
355 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.47 
 
 
361 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.15 
 
 
357 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.38 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  33.99 
 
 
351 aa  162  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.03 
 
 
348 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.88 
 
 
771 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.24 
 
 
353 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.28 
 
 
360 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
336 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.59 
 
 
401 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.05 
 
 
792 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.59 
 
 
334 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.41 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.24 
 
 
375 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  29.71 
 
 
364 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.91 
 
 
371 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.05 
 
 
353 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
379 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0926  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 
324 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.03 
 
 
340 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.14 
 
 
355 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.15 
 
 
384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.63 
 
 
341 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.63 
 
 
341 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.33 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.81 
 
 
337 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.48 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.31 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.23 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.53 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.51 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.31 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.49 
 
 
375 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3001  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.92 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207007  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.78 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.49 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.02 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3161  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.46 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.49 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.84 
 
 
335 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.84 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.31 
 
 
335 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.12 
 
 
331 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.64 
 
 
335 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.38 
 
 
339 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.03 
 
 
338 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.84 
 
 
337 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.23 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.9 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.54 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.17 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.95 
 
 
330 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.46 
 
 
325 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.13 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.57 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.96 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.76 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.51 
 
 
343 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  28.12 
 
 
343 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0777  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
315 aa  119  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.36 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.43 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.43 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0926  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.87 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.3 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.53 
 
 
353 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.96 
 
 
331 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.78 
 
 
385 aa  116  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.91 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.17 
 
 
338 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_002620  TC0682  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.47 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00304258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.91 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.77 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.16 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.56 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.95 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.94 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.67 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.2 
 
 
336 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.33 
 
 
335 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.1 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.23 
 
 
325 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.15 
 
 
339 aa  113  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.6 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.15 
 
 
339 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 
322 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>