217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0426 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
346 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  65.32 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  64.45 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  53.1 
 
 
343 aa  345  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.48 
 
 
341 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  55.62 
 
 
345 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.59 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.3 
 
 
341 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.24 
 
 
345 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.24 
 
 
339 aa  250  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.36 
 
 
326 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.83 
 
 
338 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.15 
 
 
327 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.88 
 
 
327 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.55 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.42 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.68 
 
 
337 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.71 
 
 
335 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.37 
 
 
338 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.5 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.13 
 
 
342 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.76 
 
 
340 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.28 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.28 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.79 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.69 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.24 
 
 
333 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.61 
 
 
329 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.46 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.27 
 
 
332 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.96 
 
 
332 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.61 
 
 
327 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.42 
 
 
349 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.13 
 
 
375 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.85 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.21 
 
 
330 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  36.03 
 
 
341 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.75 
 
 
335 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.66 
 
 
372 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.81 
 
 
315 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.18 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.75 
 
 
353 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.99 
 
 
371 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.34 
 
 
792 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.55 
 
 
338 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.8 
 
 
341 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.23 
 
 
335 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2807  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.11 
 
 
349 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0758869  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.69 
 
 
331 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.06 
 
 
360 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3570  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.08 
 
 
338 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  hitchhiker  0.00823889 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.28 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.89 
 
 
339 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  39.01 
 
 
378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.44 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.11 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.11 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.89 
 
 
339 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
328 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
328 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.11 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.78 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  32.65 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.54 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.89 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.54 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.65 
 
 
328 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.3 
 
 
328 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.78 
 
 
330 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.74 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.35 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.74 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.26 
 
 
361 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.74 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  35.78 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.06 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.16 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.72 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.35 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.43 
 
 
337 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.22 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.94 
 
 
353 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.98 
 
 
771 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.67 
 
 
357 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.97 
 
 
320 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.59 
 
 
378 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.62 
 
 
349 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  0.105558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.25 
 
 
331 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.47 
 
 
335 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.17 
 
 
349 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  32.36 
 
 
355 aa  123  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.77 
 
 
331 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.76 
 
 
325 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.41 
 
 
325 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.41 
 
 
325 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>