217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2371 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2371  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
346 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1804  lipid-A-disaccharide synthase  43.64 
 
 
351 aa  289  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00956685  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.59 
 
 
355 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0426  hypothetical protein  38.48 
 
 
364 aa  253  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0230  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.6 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3670  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.87 
 
 
355 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127751  normal  0.182275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07846  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.35 
 
 
334 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0181  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37 
 
 
336 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.391612  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0638  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.55 
 
 
357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.320872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.91 
 
 
353 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.6 
 
 
318 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.574216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.85 
 
 
361 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1655  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  31.36 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.703326  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0777  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.06 
 
 
315 aa  142  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  142  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.74 
 
 
346 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.85 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  32.85 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0019  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.18 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0158  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.92 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.9 
 
 
771 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.7 
 
 
357 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.23 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0645  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.16 
 
 
355 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.14 
 
 
375 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.94 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 
343 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.52 
 
 
325 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.52 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.9 
 
 
360 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.54 
 
 
335 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.97 
 
 
333 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.54 
 
 
335 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.52 
 
 
325 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.52 
 
 
325 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.52 
 
 
325 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.34 
 
 
339 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0620  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.65 
 
 
374 aa  123  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.21 
 
 
335 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0526  lipid-A-disaccharide synthase  26.9 
 
 
355 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0169  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  29.46 
 
 
371 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.01 
 
 
339 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.01 
 
 
335 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  31.91 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.53 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.91 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.68 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.75 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.19 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 
329 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.21 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.38 
 
 
381 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.59 
 
 
330 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.59 
 
 
792 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18940  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.73 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4719  lipid-A-disaccharide synthase  30.25 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.91 
 
 
341 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  31.37 
 
 
361 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.53 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.23 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.58 
 
 
327 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.66 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0575  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.8 
 
 
401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.3 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.7 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.16 
 
 
346 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.19 
 
 
379 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0926  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.86 
 
 
372 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.79 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.91 
 
 
371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.28 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.12 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.5 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  31.23 
 
 
333 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  30.54 
 
 
378 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.69 
 
 
325 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.63 
 
 
372 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.73 
 
 
349 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.79 
 
 
338 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28 
 
 
341 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.97 
 
 
372 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.33 
 
 
326 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.06 
 
 
337 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2699  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.45 
 
 
378 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0722081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.1 
 
 
331 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  31.14 
 
 
340 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30 
 
 
357 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.31 
 
 
341 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  29.79 
 
 
337 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.31 
 
 
341 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.29 
 
 
331 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  28.57 
 
 
331 aa  102  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>