More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2035 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 587 aa  1210    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  33.47 
 
 		 258 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  33.47 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  31.2 
 
 		 262 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.62 
 
 		 682 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  31.84 
 
 		 256 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  31.43 
 
 		 253 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  32.13 
 
 		 275 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  29.48 
 
 		 253 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  29.48 
 
 		 264 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  30.16 
 
 		 258 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  31.33 
 
 		 258 aa  128  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  35.34 
 
 		 289 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  28.98 
 
 		 249 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  27.99 
 
 		 264 aa  124  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  27.61 
 
 		 264 aa  124  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  27.79 
 
 		 674 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  31.2 
 
 		 259 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  29.55 
 
 		 254 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  29.84 
 
 		 257 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  29.02 
 
 		 251 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  22.43 
 
 		 605 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.07 
 
 		 678 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  30.17 
 
 		 245 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  27.05 
 
 		 245 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  26.65 
 
 		 678 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  28.91 
 
 		 255 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  23.46 
 
 		 605 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  27.06 
 
 		 323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.3 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  26.45 
 
 		 586 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.35 
 
 		 675 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.95 
 
 		 713 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.76 
 
 		 323 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  28.03 
 
 		 258 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.76 
 
 		 323 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.76 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  25.17 
 
 		 662 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.76 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.64 
 
 		 678 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.28 
 
 		 684 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  28.25 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  23.91 
 
 		 590 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  23.69 
 
 		 1138 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  29.44 
 
 		 252 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.92 
 
 		 684 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.35 
 
 		 322 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.58 
 
 		 687 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.35 
 
 		 676 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.05 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.6 
 
 		 322 aa  101  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.69 
 
 		 687 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.75 
 
 		 322 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  25.75 
 
 		 322 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.75 
 
 		 322 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.75 
 
 		 322 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.29 
 
 		 681 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  25.75 
 
 		 322 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.75 
 
 		 322 aa  99.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  29.88 
 
 		 256 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.84 
 
 		 692 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  26.22 
 
 		 586 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.84 
 
 		 692 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  23.05 
 
 		 549 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  24.29 
 
 		 586 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.88 
 
 		 371 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  25.6 
 
 		 276 aa  97.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.42 
 
 		 361 aa  97.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  24.93 
 
 		 346 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  25.86 
 
 		 627 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  28.74 
 
 		 247 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  28.74 
 
 		 247 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  26.51 
 
 		 339 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  26.51 
 
 		 339 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.72 
 
 		 382 aa  95.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.12 
 
 		 691 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  23.77 
 
 		 1148 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  23.92 
 
 		 581 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  26.51 
 
 		 339 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.67 
 
 		 689 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.01 
 
 		 690 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  22.78 
 
 		 588 aa  93.6  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.36 
 
 		 585 aa  93.6  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.29 
 
 		 322 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  25.27 
 
 		 382 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.27 
 
 		 382 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  23.65 
 
 		 596 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  26.42 
 
 		 267 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  24.69 
 
 		 379 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  24.46 
 
 		 379 aa  91.3  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.66 
 
 		 686 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  22.32 
 
 		 1155 aa  91.3  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  25 
 
 		 382 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  22.19 
 
 		 362 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  23.94 
 
 		 380 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  23.04 
 
 		 691 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  30 
 
 		 302 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  21.94 
 
 		 366 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  36.84 
 
 		 312 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  23.67 
 
 		 380 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>