82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1194 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  64.94 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  61.92 
 
 		 262 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  61.24 
 
 		 289 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  60.08 
 
 		 258 aa  305  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  56.37 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  55.6 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  49.8 
 
 		 255 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  48.61 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  49.81 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  48.83 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  51.41 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  48.83 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  45.24 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  45.28 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  44.31 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  43.92 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  45.38 
 
 		 256 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  44.31 
 
 		 264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  43.43 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  39.44 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  37.55 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  35.71 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.13 
 
 		 587 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  32.28 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  31.08 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  31.75 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  29.06 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  30.95 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  26.86 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  26.37 
 
 		 302 aa  92.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  32.16 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  29.96 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  28.34 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  32.39 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  29.73 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  27.24 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  29.77 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  36.67 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  27.65 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  30.43 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  25.1 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  32.46 
 
 		 268 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  28.03 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  35.44 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  30.36 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  26.01 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  30.36 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  31.48 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  30.36 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  32.54 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  24.26 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  30.94 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  25.22 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  31.03 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  27.57 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  29.46 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0122  MOSC  26.17 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  36.23 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  27.78 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  36.23 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  36.23 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  34.78 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  28.45 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  22.39 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  27.59 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  33.1 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  34.78 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  34.78 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  34.78 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  36.23 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  25.98 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  26.09 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  31.47 
 
 		 283 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>