90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1750 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  523  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  53.78 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  54.4 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  54.29 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  52.44 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  54.44 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  51.22 
 
 		 258 aa  254  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  51.02 
 
 		 258 aa  252  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  50 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  53.04 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  53.63 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  49.8 
 
 		 275 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  47.43 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  47.83 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  46.85 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  51.01 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  46.99 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  45.24 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  45.71 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  43.5 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  38.65 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  41.34 
 
 		 288 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  39.92 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  31.76 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  32.69 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  34.63 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  31.95 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  31.11 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  31.11 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.91 
 
 		 587 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  26.29 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  28.63 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  28.23 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  27.42 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  28.41 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  23.84 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  25.71 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  31.96 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  25.31 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  24.71 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  23.77 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  26.49 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  23.31 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  25.32 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  28.85 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  25.95 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  23.31 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  25.56 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  35.14 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  32.43 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  33.7 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  33.78 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  26.64 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  28.27 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  26.09 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  26.09 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  22.3 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  26.98 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  26.09 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  26.09 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  26.09 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  33.85 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  34.25 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  30.99 
 
 		 390 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  32.58 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  31.88 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  23.48 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  21.78 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  23.72 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  25.22 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  32.35 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  21.78 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  27.59 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  23.4 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  26.32 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  24.06 
 
 		 605 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  26.32 
 
 		 367 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  22.97 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  21.62 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  28.33 
 
 		 478 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  22.31 
 
 		 215 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>