100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2344 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  97.29 
 
 		 258 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  90.35 
 
 		 259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  69.57 
 
 		 256 aa  341  8e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  65.86 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  64.94 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  53.15 
 
 		 289 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  54.18 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  52.02 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  52.76 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  52.44 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  52.44 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  49.4 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  48.83 
 
 		 275 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  45.12 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  46.75 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  44.09 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  43.53 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  43.53 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  42.86 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  40.14 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  40.56 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  41.73 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  36.82 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  32 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  30.71 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.33 
 
 		 587 aa  128  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  31.98 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  33.59 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  29.09 
 
 		 302 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  30.08 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  29.09 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  30.04 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  30.28 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  29.39 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  29.17 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  29.36 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  26.43 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  29.86 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  27.34 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  30.64 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  25.82 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  29.17 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  28.14 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  28.26 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  26.47 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  25.09 
 
 		 366 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  26.41 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  26.47 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  28.68 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  31.51 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  29.44 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  27.47 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  26.92 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  27.62 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  25.55 
 
 		 369 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  25.72 
 
 		 369 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  24.36 
 
 		 367 aa  49.3  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  25.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  26.06 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  25.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  29.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  25.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  28.4 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  25.36 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  27.06 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  28.4 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  28.24 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  28.24 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  28.24 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  28.24 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  28.24 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  28.4 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  35.42 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  23.81 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  30.11 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  26.32 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  26.18 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  20.96 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  24.24 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  22.94 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  25.35 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  29.69 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4067  MOSC domain containing protein  26.67 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  29.02 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  29.44 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  26.03 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  32.62 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  24.54 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  24.26 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  34.12 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  26.1 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  24.47 
 
 		 370 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  24.47 
 
 		 370 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  24.18 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  24.18 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  28.63 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  28.63 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  27.82 
 
 		 288 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>