84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0588 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  84.21 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  67.59 
 
 		 289 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  63.92 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  64.82 
 
 		 256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  60.08 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  59.59 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  58.7 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  53.15 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  52.76 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  54.12 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  51.02 
 
 		 255 aa  252  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  49.8 
 
 		 276 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  50.61 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  46.22 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  47.35 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  45.56 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  45.06 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  45.02 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  44.22 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  38.37 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  38.08 
 
 		 312 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  38.46 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.47 
 
 		 587 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  33.47 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  34.16 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  32.45 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  32.8 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  30.8 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  29.08 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  29.24 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  29.24 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  27.17 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  27.2 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  28.5 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  27.56 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  25.45 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  26.38 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  29.17 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  35.16 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  29.03 
 
 		 259 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  32.74 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  26.86 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  27.02 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  28.46 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  28.33 
 
 		 268 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  21 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  25.95 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  21.4 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  33.67 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0337  MOSC domain containing protein  28.07 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  27.59 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  25 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  34.94 
 
 		 366 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  26.86 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  34.21 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  25 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2173  MOSC domain containing protein  29.79 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.470519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  36.59 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  29.36 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  38.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  38.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  38.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  22.22 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  22.22 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  38.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  38.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  38.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  38.03 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 370 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 370 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  30.17 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  26.75 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  32.76 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  36.99 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  36.99 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  36.99 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  26.09 
 
 		 367 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  35.62 
 
 		 369 aa  42  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>