77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7245 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  42.47 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  41.75 
 
 
264 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  41.49 
 
 
264 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  40.99 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  39.79 
 
 
258 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  40.14 
 
 
258 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  39.01 
 
 
255 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  38.16 
 
 
262 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  42.36 
 
 
257 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  40.69 
 
 
259 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  38.35 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  39.43 
 
 
253 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  39.86 
 
 
253 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  38.71 
 
 
258 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  36.36 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  37.99 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  36.69 
 
 
292 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  38.52 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  35.37 
 
 
275 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  35.34 
 
 
251 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  37.8 
 
 
288 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  35.66 
 
 
256 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  30.07 
 
 
267 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  42.19 
 
 
245 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  30.32 
 
 
249 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  38.6 
 
 
245 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.84 
 
 
587 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  28.87 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  30.71 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  30.14 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  37 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  26.02 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  26.02 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  31.13 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  27.2 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  30.16 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  39.36 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  32.08 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  35.54 
 
 
267 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  27.84 
 
 
269 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  29.96 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  31.25 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  33.76 
 
 
268 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  28.4 
 
 
267 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  28 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  35 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  26.13 
 
 
369 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  26.13 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  30.17 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  26.13 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  26.13 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  25.78 
 
 
369 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  38.36 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  29.37 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  27.34 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  28.83 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  28.32 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  44.78 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  31.25 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  35.71 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  28.32 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  27.43 
 
 
371 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  28.83 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  28.83 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  28.32 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  28.83 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  28.83 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  28.83 
 
 
369 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  34.75 
 
 
238 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  32.53 
 
 
287 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  31.25 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  25.29 
 
 
662 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  29.8 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  31.68 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  27.55 
 
 
478 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>