100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0306 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  53.69 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  44.76 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  44.76 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  44.72 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  44.72 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  42.06 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  37.65 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  35.16 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  35.06 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  35.23 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  36.29 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  34.87 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  34.54 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  35.2 
 
 		 276 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  31.76 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  33.2 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  33.59 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  32.81 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  32.8 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  34.54 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  29.55 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.05 
 
 		 587 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  31.33 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  34.52 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  31.68 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  31.91 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  32.8 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  31.08 
 
 		 275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  42.19 
 
 		 312 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  29.96 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  25.98 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  25.98 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  22.99 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  25.45 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  27.11 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  23.08 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  26.71 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  27.47 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  26.32 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  25.82 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  34.23 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  33.6 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  34.23 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  31.51 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  26.39 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  31.71 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  30.04 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  26.28 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  28.14 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  30.16 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  23.89 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  24.64 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  32.84 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  26.21 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  33.04 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  27.01 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  31.86 
 
 		 369 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  31.86 
 
 		 369 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  31.45 
 
 		 605 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  30.97 
 
 		 369 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  31.86 
 
 		 369 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  30.97 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  29.08 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  30.09 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  22.83 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  26.28 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  29.13 
 
 		 367 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.65 
 
 		 605 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10746  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07820)  39.02 
 
 		 419 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.673358  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  29.2 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  32.29 
 
 		 390 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  29.2 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  29.2 
 
 		 369 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  24.1 
 
 		 370 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  24.1 
 
 		 370 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  28.35 
 
 		 367 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  26.92 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  29 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  31.46 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  23.08 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  24 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  27.91 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  26.21 
 
 		 347 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4727  MOSC domain-containing protein  26.12 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4639  MOSC domain-containing protein  26.12 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  31.54 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  30.21 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  26.42 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  29.84 
 
 		 662 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  22.63 
 
 		 367 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>