77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2868 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  87.45 
 
 
247 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  87.04 
 
 
247 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  49.59 
 
 
245 aa  228  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  46.77 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  46.46 
 
 
252 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  44.76 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  37.8 
 
 
251 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  35.32 
 
 
253 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  33.6 
 
 
276 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  30.71 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  31.2 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  31.08 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  31.6 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  31.33 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  29.08 
 
 
258 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  30.43 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.8 
 
 
587 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  28.85 
 
 
264 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  28.85 
 
 
264 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  30.08 
 
 
258 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  28.34 
 
 
275 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  30.8 
 
 
254 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  28.69 
 
 
255 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  30.08 
 
 
259 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  31.13 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  27.78 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  28.52 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  30.35 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  33.46 
 
 
288 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  26.82 
 
 
267 aa  95.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  29.08 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  28.32 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  33.09 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  35.97 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  26.74 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  29.2 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  27.39 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  24.68 
 
 
366 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  32.03 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  25.09 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  26.04 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  28.37 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  22.86 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  33.62 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  26.98 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  31.71 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  26.24 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  29.91 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  23.81 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  23.81 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  27.45 
 
 
283 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  27.74 
 
 
275 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  30.68 
 
 
215 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  25.26 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  27.52 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  27.52 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  27.52 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  27.52 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  27.52 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  29.77 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  27.63 
 
 
371 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  30.48 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  27.52 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  27.52 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  27.52 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  27.52 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  27.52 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  27.52 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  27.52 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  27.52 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  27.52 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  28.1 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  29.46 
 
 
266 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>