67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1219 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  100 
 
 
288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  40.16 
 
 
289 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  42.69 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  41.34 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  41.41 
 
 
264 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  44.09 
 
 
254 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  41.73 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  41.6 
 
 
264 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  44.57 
 
 
257 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  40.24 
 
 
256 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  38.4 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  42.11 
 
 
258 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  41.73 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  38.43 
 
 
292 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  43.18 
 
 
259 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  37.55 
 
 
275 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  38.46 
 
 
258 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  37.8 
 
 
312 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  39.44 
 
 
253 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  36.86 
 
 
276 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  41.63 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  36.47 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  36.9 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  33.59 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  37.21 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.25 
 
 
587 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  30.83 
 
 
245 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  29.96 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  29 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  33.97 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  33.07 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  33.21 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  27.8 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  27.8 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  27.9 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  30.43 
 
 
259 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  26.78 
 
 
371 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  27.31 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  37.84 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  26.87 
 
 
369 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  20.49 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  20.49 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  26.87 
 
 
369 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  25.93 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  26.87 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  26.87 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  26.87 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  26.87 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  34.25 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  26.87 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  26.87 
 
 
369 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  34.25 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  24 
 
 
366 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  40 
 
 
263 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  34.25 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  35.14 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  25.32 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  33.78 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  25.84 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  25.86 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  28.98 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  25.86 
 
 
369 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  26.61 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  25.86 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  25.86 
 
 
369 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  30.25 
 
 
290 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>