92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2623 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  97.29 
 
 
258 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  90.73 
 
 
259 aa  470  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  70.36 
 
 
256 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  66.27 
 
 
257 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  65.34 
 
 
254 aa  333  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  52.76 
 
 
289 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  53.15 
 
 
258 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  53.78 
 
 
256 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  51.21 
 
 
262 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  52.85 
 
 
292 aa  261  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  51.22 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  49 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  48.83 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  44.31 
 
 
253 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  45.53 
 
 
253 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  43.31 
 
 
264 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  42.75 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  42.35 
 
 
258 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  40.56 
 
 
251 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  39.79 
 
 
312 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  42.06 
 
 
264 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  42.11 
 
 
288 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  31.2 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30.16 
 
 
587 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  33.07 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  32.81 
 
 
245 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  30.19 
 
 
267 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  30.77 
 
 
245 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  28.91 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  28.1 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  28.1 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  27.02 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  28.51 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  28.75 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  28.51 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  25.97 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  25.83 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  26.56 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  26.96 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  28.78 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  27.83 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.23 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  25.27 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  25.09 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  25.09 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  28.29 
 
 
238 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  28.99 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  24.62 
 
 
366 aa  55.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  27.43 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  28.51 
 
 
283 aa  52.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  30.25 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  27.13 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  27.48 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  25.09 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  29.93 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  30.08 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  25.89 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  26.48 
 
 
259 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  27 
 
 
277 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  28.69 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  23.93 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  30.11 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  24 
 
 
367 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  30.61 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  30.61 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  30.61 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  30.41 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  30.61 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  29.03 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  29.03 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  29.3 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  30.41 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  30.41 
 
 
369 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  30.2 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  22.71 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  30.2 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  30.2 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  30.2 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  30.2 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  30.41 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  30.61 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  23.28 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  29.03 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  27.97 
 
 
371 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  34.12 
 
 
272 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  25.91 
 
 
274 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  21.93 
 
 
262 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  25.55 
 
 
274 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  25.55 
 
 
274 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>